一、会计电算化条件下内部控制的现存问题
1.内部控制的程序化使得差错反复发生的可能性增大
会计电算化系统都具有人工系统与信息系统相结合的方面，会计电算化运用先进的信息技术，实现了内部控制的功能，优化应用程序。但是当前正是由于系统中含有内部控制的功能，促使人们过于相信程序的运行，如果程序发生了差错，而人们没有及时发现的话，就会失去有效地控制，造成会计方面不可弥补的差错。
2.数据的安全性、保密性差
每一个单位的财务数据都必须是保密的，并且对于单位发展有着至关重要的作用，一个单位的财务管理制度只有适应单位的情况，适应单位的发展，才能有效的促进企事业单位的长效发展，并且随着技术的不断成熟，很多财务软件系统都在努力尝试新技术，不断完善财务管理系统，但是当前的问题就是，很多单位旨在完善会计功能和制度方面大动干戈，却没有做好数据的善后保密工作，没有做好软件的加密工作，导致现在很多财务软件出现盗版问题。盗版财务软件在数据的可靠性和安全性上是远远不到位的，如果一旦出现了系统瘫痪，或者出现了病毒袭击的问题，可能就会导致数据丧失的问题发生，这对于会计数据的保存和企业的发展是非常不利的。
3.一身多职，越俎代包现象严重，安全意识淡漠
在过去都是采用手工记账的方式，并且很多企事业单位都存在着一岗多用，或者权责不分离的情况。而随着会计电算化的应用，人们的财务数据录入变得更加方面，也让权责更加集中，避免了由于岗位安排不合理出现的管理风险，还能有效减轻岗位负担。但是现在由于财务软件系统的应用，很明显的出现了一身多职的问题，越岗位做事情，没有考虑到数据的安全性，岗位之间缺乏有效地制约，导致舞弊情况时有发生。
二、针对上述问题，提出以下几点防范措施
1.电算化会计系统的规划管理
首先要做好硬件的配置才能做好软件的配置和规划工作，计算机的硬件必须能够跟上时代的步伐，并且要随着电算化应用程度的加深而加深;对于软件规划来说，电算化会计系统要能适应本单位的需要，能够在积极创造的过程中加深会计电算化的管理。
2.电算化会计系统的实施管理
合适的系统是优化单位财务管理的关键，并且商业化的会计核算时实现会计电算化的重要方向，软件必须经过了专业技术指标的测定才能被使用。
3.电算化会计系统的人员管理
为了实现财务管理质量的提升，必须要确保信息处理的质量，首先人员必须遵守系统的操作章程，并且必须要确保每一个登录系统的人有权限，操作员的密码必须要严格保密，不可以随意让其他财务人员知道，严格各个岗位的职责，在软件操作人员使用完毕要退出页面时，必须严格按照相应的操作步骤和具体指令退出工作平台，没有授权的人是没有资格进入系统的。所有的操作日志需要有专门的人负责保管。对于授权机制来说，每个财务人员都必须具有财务负责人的授权，没有经过授权的人不可以进入系统，严格避免越权操作的行为。密码要妥善保管，由于自身原因泄漏密码造成了数据的损失，将受到一定的经济处罚。
三、电算化会计系统的控制管理
第一，为了实现会计电算化的正常运用，必须要确保有一个高速处理数据的计算机，必须要保证原始数据输入的真实性，所有操作规范都必须根据会计软件的操作要求来进行、第二，要确保电算化数据的准确性，第三，对于输入和输入数据来说，必须要确保硬件设备能够正常运行，对于数据的打印也应当确保资料的安全性。
四、电算化会计系统档案管理
应当拓展保管和财务管理相关的其他物品，为了方便数据及时调用，应当确保信息的安全，并且财务档案应当存放在防尘、防水、防高温的地方，并且一定要确保财务档案双备份，避免资料的丢失造成重大的损失。对于各种存储磁盘应当做好表示，对于文件的修改要做好记录和调查工作。
五、电算化会计系统内部审计制度管理
1.对会计资料定期进行审计，电算化会计账务处理是否正确，是否遵循《会计法》及有关法律、法规的规定，审核费用签字是否符合内部控制制度的要求，凭证附件是否规范完整。
2.审查机内数据与书面资料、实物资产的一致性，是否账表相符、账实相符、账账相符;对不符合要求、错误的账表要及时纠正和调整。账实核对是保证医院会计资料真实、完整的根本途径。
3.监督数据保存方式的安全性、合法性，防止非法删除、修改历史数据等现象发生。
4.对系统运行各环节进行审查，如：输入、输出、存档等，防止重复、遗漏和错误操作;针对薄弱环节进行有效控制，提高系统的安全性、可靠性。
5.提高内审人员素质，培养复合型电算化人才。
信息技术时代，会计电算化是大势所趋，必须会对传统会计和管理带来革命性的变化。我们应该抓住这一机会，对症下药，不断解决制约会计电算化发展的各个环节，来促进会计电算化向更深层次更高水平发展，最大限度地发挥会计电算化的效用，不断提高会计信息系统的质量和会计工作水平，更好地为提高我国企事业单位的现代化管理水平和经济效益服务。
