随着社会公众对专项资金、预算等财政资金使用知情权要求不断提高，财政部门需要加强预算管理，采用效益审计，加强对行政事业单位经营活动的监督。
1.行政事业单位效益审计的内容和意义
1.1行政事业单位效益审计的内容
第一，经济性，合理审查预算编制和支出。
第二，效率性，审查行政单位的经营效率。
第三，效果性，合理评估单位经营过程中的经济效益、社会效益以及工作计划目标与预算执行情况等。
1.2行政事业单位效益审计的意义
首先，采取效益审计，加大了对行政事业单位的监督力度，避免单位职工滥用职权。效益审计是审查行政事业单位活动的效率性、效果性以及经济性，对单位运营情况进行严格监督，对单位的公权力有约束作用。
其次，加强效益审计，有助于提升行政事业单位的社会效益和经济效益，节约纳税人支出。我国许多行政事业单位自身创造的经济价值不大，主要依靠国家财政拨款维持运营。因此，行政事业单位必须对纳税人和国家负责，保证收支的合理性，不能浪费国家资源。
2.加强效益审计在行政事业单位中应用的措施
第一，将效益审计和满足对外公告要求结合起来。近几年，在国务院的委托下，审计署对全国人大委员会所做的审计报告引起了社会各界的广泛关注，媒体将其称为审计风暴。审计长李金华明确指出，今后需要加大审计报告公告力度，除了涉及国家机密和商业机密报告外，其他设计报告必须对社会公告。而效益审计的出现，顺应了审计报告对社会公告的要求。进行效益审计，对单位资金使用的效果性、经济性和效率性进行审查，不仅反映了被审计单位的社会效益和经济效益情况，也披露了被审计单位管理中存在的问题。
第二，合理调整审计人员知识结构，加强职工培训。实践证明，需要不断创新效益审计方法，将采访和调查研究方法贯穿效益审计工作全过程，统计分析方法贯穿于采访和调查研究方法中。效益审计人员不仅需要掌握财经知识、传统审计知识以及会计知识，同时还需要了解经济学、统计学、心理学、法律学、社会科学、数学以及公共财物管理学等学科的专业知识，拓展思路，增强自身的创新意识，提高自身分析问题和解决问题的能力，克服惯性思维，在研究问题时，从宏观性和深度上分析。目前，我国行政事业单位的审计人员基本都毕业于会计专业或审计专业，无法适应效益审计的发展需求。因此，需要合理调整效益审计人员的知识结构。但是这个调整是有一个过程的，当前任务是增强效益审计人员的创新意识，加强专业知识培训。效益审计培训内容包括：心理学、经济学、公共财务管理学、社会学等科学的专业知识;效益审计实务培训;国内外效益设计理论研究成果。必要时可以邀请有关专家或学者到单位开展专题讲座，有效解决审计机构、经济管理、法律等专业难题，保证效益审计意见的权威性。
第三，将现代审计方法和审计技术结合起来。目前行政事业单位的会计电算化水平较高，但是审计工作电算化水平落后，从而制约着效益审计工作的顺利开展。一名优秀的审计人员不仅要掌握审计专业知识，同时也需要掌握计算机专业知识，否则就失去了审计资格。高校建立了完善的财务电算化系统，且收费和注册都设置了相应了管理系统。科研机构主要是利用计算机系统来管理科研项目;检验、检疫行业都配置了报验系统，由此可知，不管从财务方面来看，或是业务方面来看，被审计单位已经完全进入了计算机管理时代，行政事业单位的审计人员如果不了解计算机审计，则无法开展效益审计，甚至连传统的财务收支审计也无法开展。因此，行政事业单位要想做好效益审计，必须利用计算机技术辅助审计，充分利用局域网、互联网和计算机，提升采集、处理、传递信息的能力，从而提高效益审计效率。被审计单位需要建立科学的电子信息库，具体包括财务数据，与审计相关的其他管理数据。采用分析性复核、风险评估、抽样审计以及内控制度测评等审计模式和审计方法，将被审计单位的历史数据进行对比、分析，并对同行业单位的横向数据进行对比、分析，准确、全面地反映被设计单位的发展历程、经营成果以及财务状况，对被审计单位的经济效益和社会效益进行客观的评价。
第四，将效益审计理论研究和实践结合起来。审计评价是效益审计的重要内容，也是效益审计和其他审计的不同之处。我国行政事业效益发展历史较短，缺乏足够的实践经验，理论研究也不够系统。目前，行政事业单位不管是财务方面，或是业务方向，都制定了一些评价指标和考核指标，可以以此为基础，借鉴和吸收国外效益审计对同类事业单位的评价体系内容，找出评价、考核指标中不合理之处，并进行改进。同时，举办效益审计理论研讨会，可以邀请参加效益审计实践的审计领域、财经领域的专家、被审计单位的审计人员、社会公众参与讨论，经过反复实践和验证，逐渐形成与我国国情相符的行政事业效益审计评价体系。站在评价范围上分析，可以从被审计单位内控制度、经营状况、管理水平、决策过程以及取得的经济效益和社会效益情况等方面来评价行政事业效益审计。
总结
综上所述，行政事业单位需要充分利用效益审计，将效益审计和满足对外公告要求结合起来合理调整审计人员知识结构，加强职工培训，将现代审计方法和审计技术结合起来，将效益审计理论研究和实践结合起来。
