科学的课程体系、合理的实践能力培养模式以及合理的课程安排是研究生教育保证的重要的环节，但是临床医学专业学位研究生的课程体系构建是一个庞大而复杂的工程，需要各个部门的紧密配合更需要与国际接轨，要借鉴国外成熟的经验来建设符合我国国情的临床医学专业学位研究生课程体系。
1. 更新教师教学观念
目前我国研究生的管理队伍，不管是指导老师还是学位的任课老师，都是学术研究型的人才，在教学的过程中，也是重理论、轻实践，重研究、轻应用，重科学、轻技术的现象仍然很严重。这就造成我国培养的研究生实践能力不行，所以，研究生的管理队伍和师资队伍要不断的更新自己的理念和教学的方式，要培养适合国家发展的应用型的人才和复合型的人才。
2. 灵活安排教学课程。
将研究生的课程安排在临床实践的课余时间，让学生根据自己的实际情况和时间来安排学习时间，缩短六个月的学位课程集中学习的时间，安排合理的学位课程时间，以保障临床课程的时间需求。
3. 实现教学模式的多样化
老师根据课程的特点和教学的目标，对学生进行不同模式的教学，在提高学生的解决问题的能力和团队精神方面还有培养学生的独立思考问题的方面，都采取不同的培养模式。要培养学生独立解决问题的能力，和处理紧急状态的能力。在教学的过程中，推进教学的网络化，这样可以减少学生集中上课的时间，老师可以将课件做出视频，发到网上，学生就可以利用自己的业余时间去学习，并且可以提高学习效果。
