手足口病属于中医学“湿温”范畴。早期干预，可有效防止并发症的发生。中医在防治上重点强调调理中焦脾胃，使脾胃功能运化如常，即便感受外邪，也很快可以被机体正气驱逐于体外。
在应用中药预防手足口病方面，家长可用板蓝根或金银花、蒲公英等清热解毒的中药煎水，给小孩服用预防感染。出现牙龈红肿者，可用板蓝根、黄芩、白藓片、竹叶、薄荷煎水含漱。对于口里长疱疹、有溃疡、口气臭的孩子，可用藿香、生石膏、淡竹叶煎水饮用，可清心火；选用西瓜霜或冰硼散、珠黄散一种，吹敷口腔患处，每日2次，可治疗口咽部疱疹。
如果孩子手足出现疱疹，则可采用外洗法，用野菊花、紫草、地肤子、苦参、黄芩、黄连、丹皮、板蓝根、白藓片、红花等煮沸，冷却至适中温度时浸泡手足，以起到清热、化湿、凉血的作用。此外，还可采用中药食疗的方法加以预防。如荷叶粥，用鲜荷叶2张，白米50克，将荷叶切碎，煮粥食用；竹叶粥，用竹叶20片，灯芯10根，扁豆15克，滑石6克，加少许糖，煎饮用；还有印花蝉衣饮，用印花15克，蝉衣3克，清茶少许，煎水饮。对于食欲不振的孩子还可在灯芯花方子里增加麦芽，以开胃。
特别需要注意的是，饭前便后、外出后要用肥皂或洗手液等给儿童洗手，不要让儿童喝生水、吃生冷食物，避免接触患病儿童；看护人接触儿童前，替幼童更换尿布、处理粪便后均要洗手，并妥善处理污物；婴幼儿使用的奶瓶、奶嘴使用前后应充分清洗。
