1、学校召开第六次党代会
9月21日至23日，我校召开转制地方后的第一次党代会，即南方医科大学第六次党代会，280名学校各界代表参会。文义民书记代表学校第五届委员会向大会做了题为《坚持科学发展，构建和谐校园，为建设国内一流、国际上有影响的多科性医科大学而奋斗》的报告。大会选举产生了新一届中共南方医科大学委员会和纪律检查委员会。
2、省委巡视组首次在我校开展巡视工作
10月10日至29日，广东省委第五巡视组在我校开展了巡视工作，通过发放民主评议表、听取汇报、审阅材料、参观考察、走访座谈等形式，对我校学校领导班子及其成员进行了监督检查。这是学校移交地方以来首次接受省委巡视。从收集的情况反映出，干部群众对本届班子的总体评价是：政治坚定、思路清晰、干事创业、廉政勤政、工作认真、作风严谨、协调配合、团结进取，具有较强的凝聚力和战斗力，是一个干部群众感到满意的班子。
3、政风行风评议工作取得优异成绩
今年3月学校启动民主评议政风行风工作，顺利完成了行评的宣传发动、自查自评、落实整改、接受评议四个阶段工作任务，有效促进了学校政风行风建设。11月25日，我校接受省直行评团面对面评议，取得初评99分的优异成绩。并在随后组织的各项评比中，成绩突出，总评分在全省高校中名列前茅。
4、思想政治理论课建设成绩斐然
我校率先成立广东省第一个马克思主义学院；《马克思主义基本原理》、《毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要思想概论》两门课被评为省级优质课程；10月30日至31日，我校接受了省高校思政理论课建设评估专家组评估，专家组对我校思政理论课建设工作取得的优异成绩和鲜明特色给予了充分肯定。
5、开展解放思想大讨论活动
自2008年初起，我校开展了为期半年的“解放思想大讨论”活动。针对影响学校发展的思想观念、体制机制等瓶颈问题，通过广泛调研、吸言纳策、成果转化和机制创新，着力强化了忧患意识、创新意识、创业意识、机遇意识和开放意识，为促进学校在新起点上的建设发展提供坚实的思想基础和精神动力。活动开展中形成的“破满、破旧、破难、破等”活动经验广受认可，并受邀在全省高校做经验推广。
6、顺德校区正式启用
9月27日，我校顺德校区正式启用，5172名大一、大二学生在这座园林式的大学校园里开始大学生活。顺德校区占地面积120万平方米（约1800亩），首期工程建筑面积约22万平方米，校区建设充分体现了中国古典园林风格和岭南历史建筑特色。
7、出色完成抗震救灾援助工作
四川汶川大地震后，我校迅速派出著名专家组成的抗震救灾医疗队3批次共27人，医疗队克服困难，冒着生命危险，率先进入震中汶川县映秀镇、水磨镇和卧龙县耿达乡，出色完成了医疗救援任务，受到国家领导人的多次赞扬。学校先后捐赠药品器械50余万元。附属医院成功救治灾区转运伤病员92名，占广东省收治伤员的10%。南方医院被授予“全国抗震救灾英雄集体”、“全国抗震救灾医药卫生先进集体”、“广东省抗震救灾先进集体”等称号，珠江医院获得了“广东省五一劳动奖状”，徐如祥获“全国抗震救灾医药卫生先进个人”。
8、国家教学团队、国家双语示范课程、国家级实验教学示范中心等取得突破
由赵克森、丁彦青教授带头的“基础医学专业教学团队”被评为2008年国家级教学团队，这是我校首次获得立项建设的国家级教学团队。赵克森教授还被评为教育部第四届高等学校教学名师。
“病理生理学”入选国家双语示范课程，我校成为全国非“211”院校唯一获得双语示范课程的院校；
“医学基础实验教学中心”被评为国家级实验教学示范中心建设单位，实现了我校国家级实验教学示范中心零的突破；
《医学影像学》被评为国家精品课程；“中医学”、“预防医学”2个专业被批准为国家第一类特色专业建设点。
我校成为全国十个教育援外基地之一，并获颁“中华人民共和国教育部教育援外基地”牌匾，是广东省唯一的国家级教育援外基地；首次获得校外资金11.2万美元，资助5名我校学生交换到美国、新加坡等国外高校联合培养博士；接收中国政府奖学金外国留学生人数达33名，创历史新高。
9、钟世镇院士获省科技奖励领域中唯一最高奖项
在2008年度“广东省科学技术突出贡献奖”的评选中，我校钟世镇院士获得了广东省今年唯一一项“广东省科学技术突出贡献奖”，该奖项是广东省科技奖励领域中的最高奖项，今年我校是全省唯一获得该奖项的科研单位。
10、首次申报省211重点建设项目获得成功
广东省取消211工程重点建设院校评审，而代之以211重点建设项目。我校申报的6个项目中有5个（用于疾病诊断的生物新技术研究、疑难病证中西医结合诊疗方案优化及新制剂研发、重大疾病的分子基础及药物筛选、器官衰竭的防治研究、应对核化生恐怖的医学防护技术研究）被批准为广东省“211”工程三期重点学科建设项目，通过项目数排全省第二，可为学校争取近8千万元的学科专项建设费。
11、首次获得教育部推荐免试研究生资格
我校获得教育部推荐免试研究生资格，对我校的本科生和研究生教育将产生深远影响，对提高我校的声誉、吸引本校优秀本科生攻读硕士研究生具有十分重要的意义。
12、科研条件建设成绩突出
成功申报了“器官衰竭防治实验室”教育部省部共建重点实验室，目前全校省部级重点实验室已达14个；
图书馆科技查新工作站被认定为教育部科技查新工作站，成为国内首批获教育部认证的医学类部级查新工作站；
热带医学与公共卫生学院卫生检测中心同时获得实验室资质认定计量认证证书（CMA）和实验室中国合格评定国家认可委员会（CANS）认可，成为我校首个同时具有出具法律效力数据结果资质和获准使用国际联合互认标识的第三方实验室；
基础医学院的司法鉴定中心通过中国合格评定国家认可委员会（CANS）的认证评审。
13、课题经费首次突破亿元
2008年度我校组织申请科研课题经费取得历史性突破，全年共获得科研课题279项，争取到各类科研经费1.54多亿元，其中国家重大科技专项获得经费支持1.1625亿元，国家自然科学基金获得经费支持2122万元，其它课题经费1600多万元，获得的科研课题总经费首次突破亿元大关，比历史年度最好成绩增加95%以上。
14、侯金林牵头的课题组获专项资助7850万元，创我校单项课题资助金额纪录
南方医院感染内科侯金林主任牵头获得国家“十一五”科技重大专项资助，课题名称为“慢性乙型病毒性肝炎抗病毒治疗方案优化及影响因素”，获得资助金额7850万元(暂定)，是我校迄今为止获得资助金额最大的一项课题。
15、首次转让发明专利使用权
陈武凡教授与宁波鑫高益公司签定了专利独占实施协议，将所拥有的3项发明专利授权鑫高益公司在其磁共振产品上独家使用，5年独家使用费150万元。这是我校发明专利的首次使用权转让。
16、全氟丙烷人血白蛋白微球注射剂创我校科技成果转让金额最高纪录
南方医院研制的国家一类新药第二代超声造影剂——全氟丙烷人血白蛋白微球注射剂，以2518万元的价格转让福满药业，创造我校科技成果转让金额最高纪录，该课题组最新研发的造影剂辅料——全氟丙烷也于今年八月获得新药证书。
17、荣获“全国大中专学生志愿者暑期‘三下乡’社会实践活动先进单位”
今年我校被中宣部、中央文明办、教育部、共青团中央、全国学联评为“全国大中专学生志愿者暑期‘三下乡’社会实践活动先进单位”，这已是我校第二次获此殊荣。
首次推出了“笃行计划”，作为社会实践的品牌项目建设。全校共16支社会实践团队获校团委资助实施实践计划，暑期社会实践活动学生参与率达到68％以上。
18、第六届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛夺得金奖
在第六届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛中，中医药学院“客粥求健”团队的《“客粥求健”连锁食疗药膳馆创业计划书》从全国近万件作品中脱颖而出，一举夺得金奖；药学院、研究生学院“天一药业”团队的《心血管创新药注射用盐酸椒苯酮胺临床研究商业计划书》获银奖；生物技术学院“云山麒麟”团队的《新型肿瘤细胞生物治疗创业计划书》获铜奖。广东省仅两个代表队获金奖，此次是我校首次冲入全国赛并一举夺金，实现了零的突破。
19、各类竞赛频频获奖，素质教育成果丰硕
2008年全国大学生英语竞赛：获特等奖2名，一等奖11名；全国大学生数学建模竞赛：获广东赛区二等奖3名，三等奖3名；全国大学生电子设计竞赛：获广东赛区二等奖1名，三等奖3名；首届中国校园戏剧节：唯一代表广东高校参加比赛的我校节目《王小山进行时》，在全国非艺术类院校短剧小品类排名第一，获“首届校园戏剧节”优秀剧目奖、校园戏剧之星奖、组织奖；省第二届大学生艺术展演：获一等奖5个、二等奖18个、三等奖3个。
20、1篇论文入选全国百篇优秀博士学位论文
由基础医学院神经生物学教研室高天明教授指导的博士学位论文“钙通道在缺血性神经元死亡和神经调节素— 1 调控 GABA 释放中的作用”，被评为2008年全国百篇优秀博士学位论文。
21、成功组织举办首届“中英生物医学创新论坛
本次论坛是中英两国政府科技创新计划第一个学术合作项目，启动了中英两国生物医药领域的高层次科技合作与交流，促进了两国高校合作伙伴和工商企业界的合作。论坛上，来自英国伦敦大学、国王学院、南安普顿大学、香港理工大学、清华大学、南京大学等国内外高校的著名专家学者进行了专题讲座。
22、工资套改等教职工关心的热点工作取得突破性进展
经过全校上下的共同努力，妥善解决了一批教职工关心的热点和难点问题：附属医院人员经费保障模式由单位自筹调整为财政核补；为随学校转制的1320名在职教师和2573名专业技术人员认证换发了教师资格证和专业技术资格证；人员工资套改工作取得突破性进展，保证了学校教职工队伍的稳定和可持续发展。
23、首次开展中层领导干部换届工作
今年10月、12月，学校转制以来首次启动了中层领导干部换届工作，此次换届工作坚持公正、公开、公平原则，充分落实群众对干部选拔任用工作的知情权、参与权、选择权、监督权，同时在选人用人的程序上也进行了大胆尝试和创新。全校共有8000多人次参与测评、推荐，完成了109名干部的述职换届，拟提任正处8名，副处12人，正科12名。
24、首次开展聘用制专业技术人员的期满考核和纳编工作
积极推进人事工作改革，首次开展了聘用制专业技术人员的期满考核和纳编工作。经严格考核和评审，共计有12名聘期期满教师被纳编。
同时，启动了中青年人才库培养计划，设立了引进博士科研启动基金，并首期择优资助了38名博士开展科研启动工作。
25、财务管理全面与地方接轨，跨入广东省先进行列
学校转制后，通过几年努力，预算编制等各项财务工作管理科学、制度健全；搭建了高起点的会计结算平台，重大经济决策建立了集体研究机制，各项经费建立了严格的经费审批程序。12月1日，省教育厅、财政厅、审计厅等上级主管部门自转制后第一次来学校全面检查、调研财务管理工作，检查结果认为：我校转制后几年里，财务管理全面与地方接轨，时间短、转制快、起点高，在短短几年已跨入广东省先进行列。
26、改革后勤保障模式，经济效益和社会效益显著提高。
我校调整后勤管理机构，整合后勤资源，对车辆、水电、物业、饮食等业务采用归口统一管理，减少管理层次，实行目标经营管理。顺德校区后勤保障服务实行外包托管与自办自管相结合的方式，物业管理采取对外承包托管模式；学生食堂和水电供应保障业务实行自办自管；通信保障采取与中国铁通佛山分公司合作共建方式；交通运输采取委托承运与自开班车保障、优势互补方式，均取得显著的效益。总务处被评为“2008年度全国高校后勤系统宣传与信息工作先进单位”。
27、校园一卡通工作顺利开展
校园一卡通系统以学校校园网为载体进行建设，是集身份识别、校内消费、校务管理、金融服务为一体的新型数字化校园核心应用项目。由中国银行与我校联合发行校园卡，师生们可以在校区内各圈存机与POS机终端实现存取款、消费、转帐等金融功能，可以代替教职员工和学生等在校内的所有个人证件如学生证、工作证、图书证、医疗证、临时证等。目前校园一卡通工作正在顺利进行中。
28、附属医院发展步伐加快
南方医院医疗收入超过12亿，建成了亚洲最大的造血干细胞移植中心及广东省最大的健康管理中心。珠江医院下半年来快速发展，医疗收入达到6.4亿元，较去年增长近50％，医疗收入达到3000万元以上的科室由原来的2增加到5个。学校调配金大地教授为代表的骨科团队充实华瑞医院，打造“以骨科为特色的综合性医院”的工作已经顺利展开。
