尽管乙肝抗病毒药都能很快抑制病毒复制，但停药后病毒复制可再次出现，谷丙转氨酶升高，个别病人发生严重的肝病。于是一些人误认为这种停药后反弹，是抗病毒药物吃上了瘾，因此不敢再使用抗病毒药物治疗。其实这种认识是错误的。
乙肝病人在抗病毒治疗后，病毒复制停止，肝功能恢复正常，肝脏组织学损伤逐渐修复，给病人带来的好处是阻断肝病进展。而抗病毒药物停药后的反弹是因为药物只起到了抑制病毒的作用，乙肝病毒并没有被完全清除。停药后病毒DNA又可再次成为病毒复制的基础，继续复制出新的乙肝病毒基因。
由于乙肝的难治性，所以需要长期用药治疗。这就如同糖尿病患者需要长期注射胰岛素或服用降糖药、高血压需要长期服用降压药、做过心血管手术的病人需要长期服用抗凝血药一样，停药后疾病都会出现反复，甚至明显加重。但这都不属于药物成瘾，因为药物治愈或缓解了病情。乙肝抗病毒药物和治疗高血压等慢性病的药物还不太一样，一旦乙肝病毒完全被抑制，获得了完全应答的疗效后，还可能会停药。为什么人们能够接受糖尿病、高血压的长期治疗，而不能接受慢性乙肝的长期治疗呢？
目前认为，对待乙肝病毒复制活跃、肝损害明显的患者，需要长期使用抗病毒药物，不给病毒一点儿活动的机会，使病毒长期处于一种抑制状态。这样才能保护肝脏不受损伤，收到持久的抗病毒效果。医生在临床工作中已经观察到，抗病毒的疗程越长，e抗原血清学转换的几率越高；同时还看到一些疗效较好的病人，最终收到了病毒完全抑制的效果，停药后也未发生反弹。
那么，什么情况下才能停药呢？临床试验证明，在乙肝病毒完全被抑制，e抗原血清学转换后还需要继续治疗6～18个月，甚至更长时间。时间越长，反弹的发生率越低。在e抗原血清学转换后半年以内停药者，80%的病人都会出现反弹；而e抗原血清学转换后持续治疗半年以上再停药者，80%都不会出现反弹。对于e抗原阴性的慢性乙肝患者，最好治疗到表面抗原阴性以后再停药。
