随着微创外科的发展，腹腔镜技术和消化内镜技术均取得了迅猛发展，但这两种技术应用于消化道疾病诊疗中均仍有不足之处。腹腔镜技术需经腹壁戳孔，易造成损害；而消化内镜在检查过程中患者需承受较大痛苦，且不能进行精细的内镜下定位操作。磁锚定技术以磁性吸力作为定位方式，通过外在磁场或磁性手柄进行定位操作，能够有效改进这两种技术。
目前，已研发出能够完全独立完成腹腔内内镜手术与辅助单孔腹腔镜外科（LESS）和经自然腔道内镜外科（NOTES）手术的磁锚定位导航系统。 其有效地解决了传统腹腔镜、LESS和NOTES手术中存在的主器械、辅助器械、照明摄像器械相互纠缠、碰撞的缺陷；减少了手术所需腹壁戳孔数目，有效减轻了手术创伤，缩短了手术时间。
现有的磁锚定技术大致可根据其磁场大小分为两种：第一种是通过磁性手柄、永磁铁产生的较小磁场的磁锚定导航技术，主要应用于腹腔镜及胶囊内镜等领域；第二种是通过外在强磁场或电磁铁作用下的磁悬浮吸引技术，主要应用于胃镜、结直肠镜等领域。
与传统腹腔镜通过“反杠杆作用”进行手术操作不同，磁锚定辅助的腹腔镜手术操作均是在腹腔内部进行。整个系统由外磁体及内磁体组成。内磁体上可携带不同的手术器械，通过脐部戳孔送入体内，通过外磁体对内磁体的控制牵拉功能，结合各手术器械，共同协作完成手术。
目前，磁锚定技术与腹腔镜（如LESS、NOTES等）技术结合是磁锚定技术发展最为迅速的领域。其原因是：一、磁锚定技术与传统腹腔镜结合，可以在不损失手术灵活度的情况下，利用磁锚定技术将腹腔镜照明摄像设备、辅助牵拉设备由腹部戳孔送入体内，并可通过隔离腹壁的磁性操纵配合进行手术。二、磁锚定技术与现有发展迅速的NOTES、LESS相结合，克服了操作空间狭小、手术开口距离手术区域远、操作不便的难题。
胶囊内镜目前已广泛应用于胃肠病变的检查中，但也存在一些不足：胶囊内镜在体内只能随着胃肠蠕动下行，检查耗时长；只能对病变部位进行观察，不能像传统胃镜或结肠镜那样及时有效地对病变部位进行操作；不能逆消化道蠕动方向运动。磁锚定技术的发展可以有效解决这些问题，使得研制可控胶囊内镜成为可能。
限制可控胶囊内镜发展的主要瓶颈是磁锚定控制的可靠性，主要有以下几点：一、与腹腔镜磁性仅隔腹壁锚定比较，胶囊内镜深达消化道中，距离腹壁位置遥远，在较胖的患者身上通过磁性手柄难以完成磁锚定操作，而且强磁场的吸引很难完成精细操作。二、由于消化系统复杂，目前仅能完成胶囊内镜快速通过十二指肠到达小肠，尚不能在小肠内进行转向、定位、悬停等操作。三、由于小肠内管腔狭窄，尚不能确定胶囊内镜是否会因为磁性吸引、压榨引起肠梗阻等并发症。
尽管目前的磁锚定技术还不是十分成熟，在临床应用中还存在磁性材料选择、磁性吸引可靠性、多个磁锚定材料互相干扰等问题。但作为一种新兴外科辅助技术，随着磁性材料技术、微电机技术及手术机器人技术与传统外科技术的联合研究，磁锚定技术必将得到进一步的发展，在消化道疾病中也会得到更广泛的应用。
