在正常人的口腔里，存活着大量的微生物。经检测，在1毫升的漱口液中，有1～50万个细菌；在1克牙垢中，有100亿个细菌；在牙床的1平方毫米的炎肿处，寄生着800万个细菌。这些细菌一般是在刷牙、漱口、吐痰时被排出体外，一部分则通过吞咽、进食、饮水被带入胃中，被胃酸杀死。也有些细菌通过血管、淋巴管或破损的口腔黏膜及龋洞，进入人体各器官，进而引起疾病。
美国牙科医生在做细菌培养时发现，无论是病人还是健康人，只要牙刷使用时间达到1个月，牙刷上就会繁殖大量的白色念珠菌、溶血性链球菌、肺炎杆菌、葡萄球菌等各种细菌。这些细菌进入人体后，能引起肠炎、脓毒血症、败血症、肾炎等疾病。因此，不保持牙刷的清洁或家人共用一把牙刷，就很容易引起交叉感染。
专家建议，最好一人两把牙刷。因为刷牙后的牙刷潮湿，细菌容易生长，需要经过一昼夜牙刷才能完全干燥。尤其是有口腔疾病、身体免疫功能低下和做了器官移植手术的人更应早晚各用一把牙刷。
此外，刷牙后，牙刷是潮湿的，细菌很容易生长。所以，刷牙后要把牙刷甩干，再让牙刷头朝上、刷毛冲下地放在杯中，并放在通风处。最好每天用1∶5000的高锰酸钾溶液浸泡1小时的方法消毒。一般牙刷的使用周期以3个月为佳。
