对于疑似肺结核或胸部X片检查肺部有异常阴影的患者必须查痰。痰涂阳性既是确诊肺结核病的主要方法，也是制定化疗方案和考核治疗效果的主要依据。但经临床观察，一个被确诊为肺结核的病人，痰涂阳性率极低，大部分是痰涂阴性。
对于呼吸系统的感染、结核、支气管扩张及占位等肺-支气管病变，物理检查如视、触、叩、听及常规化验有时不能确诊，必须行辅助检查，如胸部X片、CT等影像学检查。出于经济的考虑，过去胸部X片多是首选检查方法。但经临床观察，胸部X片有时还不能明确诊断，甚或误诊、漏诊，必须做进一步检查，需行胸部CT平扫或和增强扫描。
CT能提供断面的图像，减少重叠影像，容易发现隐蔽的病变而减少微小病灶的漏诊，能够显示普通胸片不能发现的病灶，包括小病灶和位于心脏后、脊柱旁、肺尖、近膈面及肋骨头等部位的病灶。而对肺结核的诊断，CT能清晰显示各型肺结核病变特点和性质、与支气管的关系、有无空洞形成，以及进展恶化和吸收好转的变化。对于占位病变来说，CT还可显示早期肺门和纵隔淋巴结有无肿大，更易识别肿瘤有无侵犯邻近器官和肺内转移等，为治疗提供科学合理的依据。另外，CT还可用于与其他胸部疾病的鉴别诊断及可用于引导穿刺、引流和介入性治疗等。
