益生菌一直被认为是人类肠道的好朋友，酸奶、奶酪、泡菜等都是益生菌的食物来源。但最近发表于Cell（《细胞》）杂志的两项研究发现，益生菌并非对所有人都有好处，有些情况下甚至产生负面影响。
为了验证有关益生菌的健康观念，以色列的研究团队开展了两项迄今为止关于益生菌最全面的研究。
在第一项研究中有25名志愿者。研究人员对他们进行了上内镜和结肠镜检查，以便研究人员能够在消化系统的不同区域获得各自的微生物组（即肠道的原生细菌）样本。随后，15名志愿者被随机分成两组，一组服用含有11种最流行的益生菌菌株的补充剂，另一组服用安慰剂，为期一个月。
三周后，他们再次进行了一次内窥镜和结肠镜检查，来观察微生物群落发生了什么变化。
结果发现接受益生菌补充剂的人有两种不同的反应——第一种为“存留者”，允许益生菌在他们的消化系统中驻扎；另一种为“反抗者”，将益生菌排出了体外，自身微生物群落没有明显改变。
第二项研究中，研究人员观察了益生菌补充剂是否能在抗生素使用后帮助恢复自然微生物群。研究招募了21名志愿者，分别分配到三组，一组为“观察和等待组”，由志愿者自行恢复肠道微生物；一组为“益生菌组”，补充11种益生菌菌株一个月；第三组接受粪便移植治疗，用志愿者使用抗生素前肠道内的微生物。
研究发现，“观察和等待组”和“益生菌组”在一个月后都没有恢复正常的微生物群落，益生菌组恢复速度最慢。而粪便移植组快速恢复到正常微生物群落。
通过这两项实验，研究人员认为，有些人的消化系统能够接纳补充剂中的益生菌，而有些人则会将益生菌排出体外。当与抗生素一起服用时，益生菌可能会减慢肠道益生菌恢复正常的速度。
研究作者、以色列威兹曼科学研究所（Weizmann Institute of Science）免疫学教授Eran Elinav表示，益生菌并非无害或对人人都有益处，有些人可能无法接纳益生菌，与抗生素共用反而会有副作用，甚至带来长期影响。相反的，用自身的益生菌补充自己的肠道可能是一种逆转抗生素副作用的治疗方法。
美国注册营养师Samantha Heller说，不要盲目相信市场上的益生菌补充剂，真正对肠道有益处的是多吃植物性食物。
