呼吸道感染往往是灾后首先流行的一种疾病，如感冒、支气管炎、肺炎、扁桃体炎、流感等。安徽省1991年在水灾后对传染病流行情况的调查也发现，呼吸道感染较灾前上升了31.85%。1998年，黑龙江省甘南县遭受洪涝灾害，据当时防疫部门统计，某镇灾后共有8071名患者因病就诊，其中上呼吸道感染3178名，占39.4%。2003年，淮河流域遭受百年未遇的洪水，某医疗队在灾区收治了1025名病人，其中上呼吸道感染、扁桃体炎和支气管炎三种呼吸道感染性疾病就有435名，占总病例的42.4%。
灾后呼吸道感染性疾病增多的原因主要是洪涝灾害时，受灾群众奋力抗灾，身体疲劳，抵抗力下降，加之淋雨和频繁下水，水灾后气温较低、灾民露宿等，容易受寒，导致呼吸道感染性疾病的人数增加。另外，居住环境较差，救灾安置住所人员拥挤，空气不新鲜，也容易造成呼吸道传染病的传播。灾后恢复是个漫长的工作，由于人员的搬迁，可能导致儿童漏种疫苗、灾后呼吸道传染病发病率增加。
因此，灾后不仅要注意预防消化道传染病，还要预防呼吸道传染病。首先，不要过度劳累，救灾时要注意防雨，不要长时间淋雨或在雨水中浸泡；夜间注意保暖。其次，应多宣传卫生知识，养成良好的个人卫生习惯，不要随地吐痰，不要随意丢弃吐痰或揩鼻涕使用过的手纸，勤洗手；保持室内清洁，保持室内空气流通；夏季天气较热，人出汗多，体内水分丢失快，要保证有充足的饮用水。另外，还要注意平衡饮食和营养，保持乐观向上的情绪。最重要的是儿童免疫工作不能疏漏，要按时为儿童进行免疫接种。如出现发热、头痛等症状，应及时就医。一旦患病，要在医生指导下用药治疗，多休息，多饮水，老人和儿童患病后要特别注意预防肺炎。
