(1)社会因素;
在人类生活的社会中，社会因素对于人类的健康和疾病起着一定的作用。人对环境的适应不只是被动产生，而且要在实践中主动地改造环境以满足自身的需求。人在一生中，周围环境变化是很大的，如领导、家庭、邻居、同事间关系及矛盾接踵而来。而人们对自身生存环境的变化往往是无能为力的，被动地适应和主动地适应都是不可抗拒的。适应良好，身心健康；适应不良，以致产生心理生理疾病。
社会因素对心理生理疾病的作用可以从流行病学调查结果来说明。胃癌与食管癌以日本人患病率为高，冠心病患病率最高者为美国和芬兰，最低为尼日利亚。这里有种族差异、饮食习惯、人口年龄组成、体力劳动多少等因素的作用。但总体上这些疾病的患病率是发达国家高于发展中国家，城市高于农村，脑力劳动者高于体力劳动者；居住拥挤、生活条件恶劣、要做较多努力者患病率较高。另一种心理生理疾病患病率较高的群体是移民，在我国，尤以从条件好的国家如美国或西欧迁来者发病率较高；而从中东地区迁来者，患病率就低一些。
(2)心理因素;
心理因素指个体本身的心理素质、心理发育和心理反应。而生物因素与社会因素是以心理因素为中介而作用于人体的。不良的心理刺激常可导致机体的心理或生理反应。一般而言，引起人们产生损失感和不安全感的心理刺激最易致病。
生活事件能引起人们的心理反应，并伴明显的生理应激。研究表明，很多疾病，尤其心理生理疾病常常由于生活事件引起应激而诱发。
(3)生理因素;
生理始基与生理中介机制是产生心理生理疾病的两个重要方面。
生理始基，是指心理生理疾病患者病前的生理特点。不同的生理始基，使个体具有不同的相应心理生理疾病的易罹性。例如在溃疡病发病中，由于胃蛋白酶增多，消化了胃的粘膜引发溃疡。溃疡病人病前胃蛋白酶的前体——胃蛋白酶原含量高，就是溃疡病的生理始基。仅有溃疡病的生理始基，也不会直接导致溃疡病。有溃疡病生理始基的人群中，心理社会刺激起“扳机”作用。研究还发现甘油三酯是冠心病的生理始基，高蛋白结合碘是甲状腺机能亢进的生理始基。
心理社会因素以及各种信息影响大脑皮质的功能，而大脑皮质则是通过生理中介如植物神经系统、内分泌系统、神经递质系统和免疫系统等影响内环境平衡，使各靶器官产生病变。
综上所述，在心理生理疾病的发病机制中，社会因素、心理因素、生理因素交织在一起，共同影响机体内环境的稳定，使机体防御机制崩溃，从而影响机体健康，导致疾病的发生。
