有炭疽病和根线虫病。炭疽病主要为害麻茎，病斑黑褐色，圆形或椭圆形，病斑扩展而引起茎皮破裂，降低纤维品质。根线虫侵染后，根部发生黄色瘤状物，腐败后破裂，使麻株枯死，主要虫害有小地老虎、黄麻夜蛾等。
1、症状
苗期、成株均可发病。苗期染病 出土后 数天即见发病，先在叶边缘产生灰黑色小斑点，后扩展成半圆
形至近圆形黑褐色斑，幼株茎部一段一段地变褐腐烂或全株变褐腐烂，严重的病苗枯死。成株染病 叶片上初生浅黑色近圆形病斑，大小3-5mm，中心具1小黑点;叶柄染病时，病斑长椭圆形稍凹陷，黑褐色;茎部染病也生黑褐色或黑色近圆形至不正圆形凹陷斑，有纵裂痕，大小2-3mm;蒴果染病，初生粟粒大小黑褐色凹陷斑，严重的侵入到种子上。
2、防治方法
(1)因地制宜选育和种植抗病品种。圆果种黄麻较长果种抗病，在长果种中抗性也有差异，浙江选育的长果种1-23较抗病。
(2)加强田间管理。
①适时早栽，与雨季错开，合理密植，注意通风透气;
②科学施肥，注意增施有机肥和钾肥，提高植株抗病力;
③合理灌溉，雨后及时排水，防止湿气滞留;
④及时拔除病苗，集中烧毁或深埋，收获后清除田间病残体，减少来年菌源。
