芦柑易发生芽变，采集接穗前应先选树。应选择无检疫病虫对象(黄龙病等)的丰产、稳产、优质、果形好、品种正的健壮优良母树。一般可结合优株选育，于每年冬季采收前到果园选出优良单株，做好记号挂上牌，以便采穗。采穗时应采取树冠外围中、上部生长充实、芽眼饱满、粗细适中、枝面平直、无扭曲凹陷、叶片完整、叶色浓绿、无病虫害、已木质化的横切面呈三角形的秋梢或春梢。不宜采用树冠下部及内膛隐蔽枝、徒长枝，因这类枝条不充实，营养积累不良，嫁接成活率低，或不萌发，或接后生长差，或结果迟。
采接穗的时间，一般在枝条充分成熟、新芽又未萌发时最好，这时枝梢最充实，养分积累最多，嫁接容易成活，接后萌发快而整齐一致，苗木生长健壮。采用切接的大多在春节前采集。采穗最好在静风、晴朗、露水干后的上午，或下午阳光较弱时进行。碰到雨天，应于天晴2~3天后采集。如确需在雨天采集时，采后应将接穗及时摊开晾干，再包装贮藏，以免接穗腐烂。
接穗从树上剪下后，应立即将叶片连同叶柄一起摘除，用于芽接的接穗只剪去叶片，每50~100条扎成一捆，挂上标签，然后用湿布或棉纸先包裹，外包塑料薄膜。采穗的数量可根据育苗的数量来决定。普通的一枝秋梢，约可取5~10个接芽，若要嫁接1万株苗，大约需要1500条接穗。
接穗一般随采随接成活率最高。但大量繁殖时，大多需要嫁接前采集接穗并加以贮藏，以备母树发芽后使用。贮藏时可采用沙藏法，即取干净河沙，一层接穗一层河沙掩埋贮藏。接穗以竖立为好，贮藏时间短的平放亦可。河沙的湿度以含水2％左右为宜，即以手握沙能成团，手指缝可见水而不滴水，手指松开时，河沙可松开为度。河沙过湿，接穗容易腐烂或发芽；过干接穗易脱水而失去活力。贮后每隔1~2周检查一次，河沙太干时，应及时喷水调节湿度。
远途运输或短期贮藏的，可每100~200条用湿布或棉纸包裹，外套塑料薄膜袋小扎住袋口，约可贮藏1个月。若直接将接穗放于塑料薄膜袋中，袋中常有水滴凝结，接穗易腐烂。
