贮藏蒜种可在表土结冻前，选择地势较高的背阴处挖贮藏沟，沟深50～60厘米，沟宽60～70厘米，沟长可根据贮量的多少而定。在当地气温降至-12℃时，开始入沟贮藏。
贮藏前2～3天，将蒜种充分晾晒，以减少蒜种的含水量。埋藏时，将沟底用砖头或木棍等垫起，高5厘米～10厘米，然后将蒜头堆放在上面，堆至距地表15厘米～20厘米处。蒜头上面用木棍、纸壳、草苫子搭棚，四周再用土埋严，以防透风。盖棚时，在棚的一侧垂直绑一根细管，管内吊一支温度计，以便随时测定沟内温度的变化。
贮藏期间沟内温度应控制在0℃～10℃，当温度低于-10℃时，应加盖草苫保温，待温度回升后再及时撤掉。冬季降雪后，要在雪融化前将积雪清除干净，防止雪水流入沟内。
早春时，于播种前2～3天将蒜种取出，经轻度晾晒后，即可分瓣播种。这种贮藏方法，使贮藏期间的蒜种处于0℃以下的低温条件，呼吸作用处于停止或半停止状态，减少了蒜种的营养消耗。播种前，蒜种硬实，颜色雪白，新根萌发整齐一致，播种后植株生长健旺，产量明显提高。
