大规模养殖，鲟鱼苗种和商品鱼的运输，特别是长途运输成了鲟鱼生产经营过程中的一个重要环节。笔者曾从北京、江苏等地运输各种规格、各品种的鲟鱼种、商品鱼分销至上海、杭州等地，运输平均成活率达99％以上。以下是我们在苗种长途运输方法上积累的一些成功经验。
1 、运输准备 做好起运前各种材料准备工作，根据苗种大小确定不同规格的包装材料，如泡沫箱、网袋、冰、冰袋、塑胶袋或塑料袋、氧气瓶等。在装运前8 ～24小时停止喂食，2小时前加大增氧，0.5小时前池水加冰降温，使水温降至10—15℃ 。
2、 包装方法 选择无病、无伤、体质健壮的鱼，分级筛选，使每个包装内的鱼规格相近。将待运鲟鱼苗种过数，分别带水装入事先准备好的包装袋中。充足氧气后扎好，平放进泡沫箱中，并用封口胶封口。在装运鲟鱼苗种时，由于鲟鱼棘骨较多，操作时应小心谨慎，以免划破包装袋。装箱时根据气候情况，先在箱中放入冰袋(2～3个)，以防途中升温。运输工具可根据苗种数量多少、路程远近、气候情况分别采用车辆或飞机等。
3 、注意事项
3.1 掌握好包装袋中温度、鱼、水、气之间的关系 鲟鱼为亚冷水性鱼类，性情较温和，在运输过程中一般不会出现剧烈运动。但鲟鱼耐低氧能力较差，一般来说鱼和水所占容积是整个包装袋的1／3，氧气容积占2／3。在实际操作中，要确保降温效果，应根据鱼体大小灵活掌握，鱼苗个体较小时，应适当降低水的用量(不低于1／4)， 以减少运输费用。若鱼苗个体较大，在保证溶氧足够的情况下可适当增加水的用量，以鱼体整个浸入水中为宜，以避免鱼体刺破氧气袋(但不应超过2／5)。水的数量是决定运输成本的可变部分，控制水量一定程度上是控制运输成本。
3.2 包装 鲟鱼体被五行骨板，全身骨骼均为软骨，对商品鱼运输中的包装材料、包装密度要求较高。我们对大规格的商品鱼，采取降低包装密度，且每条鱼装一个特制网袋后再放入包装袋的方法来提高成活率。
在养好鲟鱼的前提下，只有在运输成本、包装成本和运输成活率之间寻找平衡点，才能保证运输效果，在市场竞争中立于不败之地。
