外购育珠蚌涉及到运输问题。运输方法不当会产生较高的死亡率。有的从水中捞起直接装运，有的则堆放在运输工具(如船)中，再加上些水运输。前者称为“干运法”。干运法往往死亡率较低。通过实验，育珠蚌露空后，它的新陈代谢能自我调节变低。例如，心跳频率露空后只有在水中时的33%到55%。另外，蚌在出水后，它的外套腔内仍长期保存有少量水，这样，蚌露空后便能暂时凭借这些水，在相对较低的新陈代谢中存活较长时间。况且空气中的氧也可直接溶到这些水中或和湿润的蚌体表接触，进行气体交换。
如果把露空的蚌放回少量水中，它的心脏博动便很快恢复到原来水平，这说明新陈代谢加强了。但是把大量的蚌堆积在容器或船中，加入少量的水，蚌的新陈代谢便保持在原来水平，然而水量又不足，使得蚌的外套腔内排出的脏物以及代谢物大量积聚，水质很快恶化，影响蚌正常生理活动的进行。而且，这些水反而形成一层“水封”使蚌和空气隔离。
运蚌最好用“干运法”。在购蚌当地，选择好的水域把蚌摊放在水中，使蚌外套腔吸足新鲜水，运输时再捞起。挑出破损和死的蚌，另外安放，以避免途中死亡蚌腐烂，毒害健康的蚌。装运时用湿草包或稻草间隔地装填，但蚌不能装得层次太多。上面要加遮太阳设施。途中时间如太长，可在半途将蚌卸下，放到新鲜水中，让蚌的外套腔交换新水，然后再起运。由于蚌受震动容易把外套腔的水“吐”出，所以，在运输过程中手脚要轻，避免剧烈震动，更不可用锄耙用力钩耙。蚌应平着放置，这样，可减少蚌体损伤和外套腔内水分的损失。蚌运回之后要立即分散到良好的水域中暂养起来，再根据蚌体情况饲养不同的时间之后再进行手术，这样可减少因运输和手术后的死亡。
