虽然初冬不易发生大的传染病，但由于气温多变，奶牛抵抗力下降容易发病，养殖户仍不能掉以轻心。
感冒 初冬气温波动较大，容易引起风寒侵体，导致以呼吸道为主的感染。患病牛主要表现为精神不振、嗜睡；羞明流泪；体温升高，有时达40℃以上，耳尖和四肢末梢发凉；食欲减退，反刍次数减少甚至停止；伴有呼吸困难、咳嗽；初期时鼻液增多，多是粘液性鼻液，澄清透明如清水样；病程长者则鼻液浓稠，白色或灰白色。
治疗以解热镇痛、抗菌消炎为主。解热镇痛可用复方氨基比林、或30%安乃近、或安定痛、或柴胡注射液20-50毫升，一次肌肉注射；或者阿司匹林15-20克，一次灌服，每天2次。
初冬多由外感风寒所致，治疗应以祛风散寒为主。可用荆防败毒散：荆介、防风、桔梗各30克，羌活、独活、柴胡、前胡、枳壳各25克，茯苓45克，川芎、甘草各25克，共为末，开水冲调，一次灌服，每日2剂，连用2－3日。除了药物治疗外，还需要加强饲养管理，补充水分、营养、维生素，同时做好防寒保暖工作，防止贼风侵袭。
瘤胃积食 秋冬季节，由于新鲜草料不足，粗老、干硬饲料比例增加，精料饲喂量也有所增加，这就容易引起大量食物滞留于瘤胃，导致瘤胃壁过度扩张，蠕动机能减弱。
临床症状：病牛左腹部显著膨大，左肷部充满；触压坚实；病牛食欲废绝，反刍停止，嗳气酸臭；瘤胃蠕动减弱。
治疗：以消食化积、泄下为主。硫酸镁或者硫酸钠400-500克配成10%溶液，加入鱼石脂20-30克，一次内服；也可以内服豆油或者液体石蜡，每次1000-1500毫升。同时应促进病牛的反刍，10%氯化钠溶液300-500毫升，一次静脉注射。
若是过食糠、麸、玉米、豆类等易膨胀的饲料引起，初期应限制饮水，后期可饮用碳酸氢钠水。
瘤胃臌气 当牛吃了大量的易发酵的饲料后（如大量的青绿饲料、发酵或霉变的青贮饲料以及不易消化的油渣、豆类等），会使饲料在瘤胃内发酵产生大量的气体，气体不能顺利排出而引起的瘤胃极度扩张。
临床症状：病牛的左腹部急剧膨胀，腹壁高度紧张而有弹性；叩诊时为鼓音；瘤胃蠕动减慢甚至消失；后期时，牛的静脉怒张，呼吸困难。病情严重有窒息危险者首选瘤胃穿刺或胃管插入放气（间歇性放气）。
治疗：非泡沫性瘤胃臌气以止酵消胀为主。可用①生石灰150-250克、水1500-2500毫升，取上清液内服。②鱼石脂15-25克、松节油 25-30毫升、酒精100毫升，常水（或食醋）1000毫升，一次胃管投服或瘤胃注入。泡沫性瘤胃臌气以灭沫消胀为主。可用表面活性药物：如二甲基硅油 2－4克；或用消胀片（含二甲基硅油25毫克/片）100-150片，内服，能迅速奏效。
腐蹄病 草料中钙、磷不平衡，致使角质蹄部疏松，加上圈舍潮湿，蹄部经常为粪便等所浸泡，使得局部组织软化。另一方面由于地面的石子、水泥等易滑倒等因素，经常引起蹄部发炎。
临床症状：病牛食欲降低，站立时患蹄负重减轻，跛行、疼痛，按压蹄部时出现痛感。有时削扩创后，蹄底即有黑色的臭水流出，趾间也能看到溃疡面，上面覆盖着恶臭的坏死物；重者蹄冠红肿，痛感明显，奶牛产奶量明显下降。
治疗时应先修整蹄形，挖去蹄底腐烂组织，并用饱和硫酸铜或5%碘酊消毒。然后，用青霉素20万单位，溶解于5毫升蒸馏水中，再加入50毫升鱼肝油，混合搅拌，制成乳剂，涂于腐烂创口。深部腐烂可用纱布蘸取药液填充，而后包扎，每天换药1次。也可用生姜80克、大蒜30克，石菖蒲、旱莲草各45克，艾叶、一点红各25克，鱼腥草100克，混合捣烂，外敷患部，并用纱布包牢，每日1-2次。同时，应注意蹄部的日常维护，必要时可以考虑设立消毒池，内放1%-3%的硫酸铜溶液，让牛经常浸泡。
乳房炎 在物理、化学或者生物的因素的刺激下，有可能会引起奶牛乳房炎。在日常生产的过程中，则主要是在各种刺激下引起的微生物的感染。
临床上可见乳房炎产生红、肿、热、痛等炎性症状，伴有泌乳量减少或停止，乳汁内混有凝块、血液、脓液等病理性产物；严重时可出现乳房明显肿大、乳房质地变硬、体温升高或全身反应；隐性乳房炎时，乳房外观上并无病理学变化，但是会引起产奶的数量与质量的降低。
治疗以抗菌消炎为主：0.25%-0.5%的盐酸普鲁卡因150-300毫升，青霉素40万单位乳房封闭；也可以用热敷法，每天1-2次，每次30分钟。顽固病例采用生殖股神经封闭疗法。
预防：搞好环境卫生，注意挤奶的流程和挤奶的卫生，必要时可以用0.3%-0.5%的洗必泰或0.05%的新洁尔灭进行乳房药浴。
