随着水产养殖的集约化程度的逐步提高，水产养殖中病害常有发生。鱼病的发生不仅影响了养殖品种的品质，还制约了养殖的产量和效益。
在防治鱼病过程中经常遇到看似一种“简单”的病症，但在实际治疗过程中却发现哪怕穷尽了各种办法，浪费了大量的钱财和时间及精力，却还是总得不到应有的治疗效果，造成了大量的损失。
当然，有些鱼病本身顽固当然不好治愈，但有一些鱼病造成久治不愈多是人为因素促成，须加以重视和克服。
一、鱼病的误判
比如引起烂鳃病的原因有很多种，常见的有四类：
1、寄生虫引起的烂鳃病（如指环虫，车轮虫，杯体虫等）。
2、细菌性烂鳃。
3、其他疾病继发感染引起的烂鳃症状（如肠炎病、营养不良引起的烂鳃）。
4、其他其它因素引起的烂鳃症状（如水质恶化引起的烂鳃）等。
如果不能对病因做出准确的判断，仅凭病鱼鳃部表现出的腐烂症状就简单诊断为细菌性烂鳃，有可能就很难达到满意的治疗效果，这是鱼病久治不愈的最重要的一个原因。
二、病情主次不分
现在的很多种疾病，单一病症的很少，大部分都是几种病症混杂在一起，但一般都是以一种或两种疾病为主，其他表现出来的疾病症状大多都是因为主要疾病的继发感染引起的，比如指环虫病、锚头鳋病往往伴随着细菌性烂鳃病，草鱼“三病”往往同时发生等。
如果治疗的先后顺序，侧重点产生偏颇，都会造成疾病的蔓延。多表现在一用药死亡量就下降，药一停死亡量就上升，反反复复，疾病总是难见好转。
所以，在治疗过程中一定要分清主次，先治疗主要疾病，后治疗次要疾病，对其中比较严重的疾病得到基本控制后，再针对其余的鱼病用药。
三、 药物选择不当
当前市场上鱼用药物种类繁多，仅就治疗细菌性烂鳃病为例，就有氯制剂、二氯制剂、三氯制剂、二氧化氯、季铵盐类等等。
各个厂家生产的药物品种就更是五花八门。厂家往往给新药冠上一种神乎其神的名字，标签上介绍应用范围特别广，效果特别好，几乎包治百病。
有些所谓的"新特药"仅仅是换了个名字，药物成分还是没有什么大的变化。建议最好选择自己熟悉和对药物成分了解的药物；对于比较新颖的养殖品种的用药或者自己不了解的新特药，多向有关人员询问，必要的情况下可先实验性治疗进行尝试。
四、药物浓度不足
药物浓度偏低，病原也容易产生耐药性(并非只有高浓度才产生耐药性)，沉于水体的虫卵更得不到彻底的杀灭，容易重复感染造成久治不愈。凡药物都有一定的作用浓度，药物说明书上的用量往往是在一般理化条件下的推荐用量(多是低剂量)，不能死板套用。用药时要根据养殖鱼类、养殖条件（如有机质，水温等）和养殖方式等进行调整，个别情况下调整的范围还比较大。 如果长时间采用低的治疗浓度，仅能对致病菌起到抑制作用，达不到杀灭的效果，变相的让细菌、寄生虫等病原对药物有了一定程度的适应，造成了耐药性。
五、用药疗程不够
用药疗程不够，容易造成致病菌得不到彻底的杀灭，会反复感染鱼体，最终产生耐药性。很多疾病从用药治疗到治愈都有一个过程，一般都需要一个疗程或更长一段时间的连续用药。如果在病情稍有稳定后就停止用药是不能保证病不反复的，因此，用药后发现死鱼减少或停止，还应该继续用药以确保疗效，否则，病原菌就有可能在含有较低药物浓度的机体内顽强生长、繁殖，逐步产生耐药性，甚至发生变异。
六、轻易更换药物
在鱼病治疗中有一种情况，用药后发现死鱼没有停止甚至反而增多，出现这种状况除了是因"认错病"形成的之外，其主因多为"是药三分毒"之故。
大部分药物在杀灭病原的同时，对鱼体都有或多或少的刺激性作用，一些症状严重，濒于死亡的病鱼或者有个别鱼儿已经虚弱本身就该淘汰,(见"正确认识水产养殖生产中的淘汰死亡"文)，在用药后可能还加速了它的死亡过程，很多人看到这种情况即认为所用药物没有治疗效果，一种药还没有见效，马上又换另一种药，其结果是鱼病没治好，成本又增加了不少。
因此，频繁换药，也会导致鱼病久治不愈。
七、抗药性的影响
长期使用同一种药物或高剂量施药治疗鱼病，病原体容易产生耐药性，哪怕是特效药亦如此。平常在用药时，有些人的药物剂量往往超出正常的一半及以上，导致鱼类的抗药性和药物残留问题越来越严重。长期使用一种药物防治鱼病开始效果会很好，但是时间长了以后药效往往会减弱，这是因为病原体对药物产生了抵抗力，即耐药性。因此，要不定期的更换药物的品种(成分)进行交替使用，但要注意的是：有时换了个品牌的药物，但是药物主要成分还是一样，应该是采用不同的药物成分，方可避免抗药性的出现。
总之，水产养殖重在“防患未然”而不是“亡羊补牢”。病害防治一定要以“预防为主，防重于治”为原则。
