玉米秸秆还田，可以增加土壤有机质含量、改善土壤理化性质和团粒结构，已成为各地培肥地力重要的增产措施。但配套技术不到位，会导致后茬小麦苗黄、苗弱、病害加重及缺苗断垄等现象发生。
防苗黄苗弱玉米秸秆还田后，秸秆中的养分不能直接被作物吸收利用，必须经过微生物分解。适宜土壤微生物活动的碳氮比为25～30∶1，而玉米秸秆的碳氮比为80～100∶1，如果土壤中氮素不足，就会导致微生物和小麦争氮，小麦因缺氮出现苗黄、苗弱现象。在小麦正常施肥的基础上，可以每亩增施尿素5～7.5公斤，以满足小麦及微生物对养分的需求，并加快秸秆分解腐烂。
防病虫危害玉米秸秆上往往带有大量病菌和虫卵，在秸秆直接粉碎过程中无法将其杀灭，还田后留在土壤里，农田病虫害特别是地下害虫有逐年加重趋势，危害小麦正常生长。小麦播种期要“防重于治”，做好种子药剂处理与麦田病虫害综合防控。最好选购包衣种子，或者进行药剂拌种，地下害虫严重发生区还可以用药进行土壤处理。
防缺苗断垄大量玉米秸秆还田，使土壤变得疏松和空隙增大，失墒较快，小麦种子与土壤难以紧密接触，影响发芽出苗，田间出苗常不整齐，容易出现缺苗断垄现象。应对措施：提高秸秆还田质量，坚持秸秆还田深翻，旋耕麦田必须镇压；秸秆还田后播种小麦，播种量应在正常基础上每亩增加0.5～2公斤，随播种随镇压，使种子与土壤紧密接触，以保证充足的基本苗；足墒还田、播种，确保一播全苗，播后墒情不足时及时浇水，浇水后及时中耕划锄破除土壤板结。
