一、生产工艺
复混肥，顾名思义就是把几种肥料按一定的比例混合在一起，通过粉碎和机械混匀后造粒而成，工艺比较简单，一般生产设备投资不大，多为中小肥料生产企业采用。
复合肥，是将几种肥料按一定比例通过化学反应合成新物质，并通过造粒形成的。生产设备投资较大。一般小肥料企业生产不了。
二、养分含量
复混肥养分含量可根据需要任意调配，肥料配方比较灵活，适合生产配方肥。养分含量上下波动大。
复合肥只能把几种肥料按一定比例进行化学合成，养分配比相对固定，不易调整。适合生产通用肥料。养分含量比较稳定。
三、颗粒硬度
复混肥由于只是通过滚筒造粒，颗粒大小均匀，硬度一般较小。
复合肥由于采用化学合成，生产工艺比较复杂，颗粒硬度一般较大。
四、养分利用率不同
复混肥由于溶解速度较快，一旦养分不能及时被作物吸收，很容易流失，利用率较低。
复合肥由于颗粒溶解速度慢，养分释放的速度也较慢，不容易流失，因此，利用率较高。
五、价格不同
复混肥的生产成本低，只要把各种基础肥料配齐，掺在一起搅拌均匀造粒就可以了。因此，价格相对便宜。
复合肥生产需要提供一定的条件，让原料进行化学反应，然后再喷浆造粒，所需的成本比复混肥高的多，因此，价格也相对较高。
