微生物肥料又称菌肥或生物肥料。是一类含有活微生物的农用制品。因为它含有活的微生物，所以在施用复合生物肥时要一定要注意以下几点：
1.施用菌肥的最佳温度是25℃~37℃低于5℃或高于45℃，施用效果较差。
2.在高温、低温、干旱条件下，农田不宜施用。
3.应有适宜的温度。例如，固氮菌最适宜的土壤相对含水量为60%~80%。
4.不应将菌肥与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫的化肥（如硫酸钾等）以及稻草灰混合。因为上述农药或肥料，物质很容易杀死生物菌。如需同时使用，应先施菌肥，隔48小时后，再打药。
5.对土壤条件有一定的要求。含硫高的土壤，不宜施生物菌肥，因为硫能杀死生物菌。生物菌肥在有机质含量较高的地块施用效果较好。相反，用在有机质较少的地块效果不佳。
另外，特别需要提示：①生物肥料是一种含一定化肥的复合菌肥。它是一种辅助性肥料，而不能代替化肥和有机肥。②施用时要考虑温度、湿度、农药、土壤肥力等因素的影响。③生物菌肥不是速效肥，在作物的营养临界期和营养最大效率期应与化肥配合施用。
