调控基肥和追肥。一般基肥应占总投肥量的60%，基肥施用的磷可占到整个生长周期的70%，而优质农家肥、厩肥每亩不宜超过5000千克。
增施有机肥。有机肥可提高土壤的保水保肥能力，又能调节平衡土壤的酸碱度以及避免土壤因集中供肥发生肥害。
禁止浅层追肥。棚室种植蔬菜由于密封性能较好，浅层追肥或撒施肥料，极易使挥发的肥料对蔬菜产生为害。因此追肥时一定要穴施或条施，深度为5～6厘米，另外还要和蔬菜根系保持8～10厘米的距离。
适温追施氮肥。追施氮肥应选择在晴天中午前后进行，过早过迟都会由于温度低而降低追肥效果。追施氮肥时最好用0.5%～1%浓度的尿素溶液于15℃以上时进行根外追肥。
