一、生理病害 苹果苦痘病是缺钙造成的，在果实采收后可用2～4%的氯化钙溶液浸果，并注意入贮果实前期温度不应过高，以避免该病的大量发生；苹果虎皮病是因果实成熟度不够而早采引起的，可在果实采收后，用500～1000ppm的卵磷脂液浸果，并尽快进入低温条件贮存；果肉褐变是因低温、缺氧和二氧化碳中毒造成，防止果肉褐变要抓好适期入贮。
二、真菌病害 包括轮纹病、炭疽病、青霉病和霉心病等，因这几种病害在果实生长发育时也大量发生，在果实入库前要严格选果，防止病虫果入库。
轮纹病和炭疽病 采前可喷50%多菌灵或50%甲基托布津800倍液，对两病有较好的防治效果。贮藏前，用500～1000倍50%多菌灵或800倍50%甲基托布津药液浸泡果实，也可以用多功能保鲜纸包果。同时，贮藏期要适当降低贮藏室的温度，若用气调，应该适当提高二氧化碳浓度，降低氧的浓度。
青霉病 1.入贮前两周，对贮藏场所用硫磺熏蒸，每10立方米空间用硫磺100～200克，也可以用50%福尔马林500倍液喷洒消毒，每10立方米空间用0.5公斤药液。2.入贮前，用500～1000倍甲基托布津或多菌灵浸果。3.贮藏温度应该保持1～2℃，并且经常清除病果。
