沼气池肥料的养分含量，主要决定于配料的比例、酸碱度、发酵温度、密闭程度、水分及沼气细菌的接种等因素。沼气池肥是矿质化和腐殖质化过程进行比较充分的肥料，它较一般有机肥料的利用率高得多，且具有速效、迟效养分兼备。腐殖质含量较高和富含激素、维生素类物质的特点。
沼渣的氮、磷、钾三要素的含量较一般堆、沤肥为高。沼液全氮、磷、钾含量与一般无土厩肥相近，但沼液中的有效养分高于厩肥或厩肥液。
沼气池肥除含有上述营养成分外，有机碳含量高于堆沤肥，而沼渣富含腐殖质、木质素、纤维素等，具有良好的改土作用。沼渣做基肥，可按沼渣:草皮土:磷矿粉为100:40:10比例混匀，堆沤1个月左右，用做菜地基肥，增产效果极佳。沼液可直接用于蔬菜的追肥，沟施或以水冲肥，还可做叶面喷施。不论是沼渣还是沼液，在蔬菜上施用增产效果显著。
