症状发病较轻的果实，部分维管束变褐坏死，果实外形虽没有变化，但维管束变褐部位不转红。发病较重的果实，果肉维管束全部呈黑褐色，病果胎座组织发育不良，果实表面呈明显着色不均，严重时发病部位呈淡绿色，表面变硬。
分析番茄筋腐病最主要的症状是果实着色不良，而光照不足、氮磷钾失调、根系受伤都会造成果实着色不良，因此可断定是栽培条件不适引起的。如遮阳网全天覆盖，导致光照不足。遮阳网只在晴天中午覆盖即可，傍晚及阴雨天要及时撤掉，以确保番茄的见光时间和光照强度。再如施肥时氮、钾比例失调，番茄结果期需求钾肥的量大，约是氮肥的1.8倍，追肥时氮肥量过大，钾肥不足，筋腐病发病率高。另外，经常施入尚未腐熟的粪肥，也会加重此病的发生。
防治对于已经发生筋腐病的棚室番茄，可在增强光照的情况下，叶面喷施磷酸二氢钾200~300倍液，或乐得叶面肥500~1000倍液，或芳润叶肥800~1000倍液，快速补充养分，减少后期果实出现筋腐病果的几率。
