底肥是施肥中最基本的一个环节，对蔬菜作物生长发育至关重要，施用底肥一般要从四个方面考虑：即底肥的种类、数量、肥料品种及施用的方式。
从种类上看，有机肥（包括农家肥、厩肥和饼肥）最适宜作底肥施用，氮、磷、钾和微肥也皆适合作底肥，土壤肥力较高的高龄大棚应注意多施一些生物肥作底肥。
从施肥量上看，要确定底肥施用数量，必须考虑土壤肥力高低，在有机质低于1.5%的土壤应亩施用有机肥（以鸡粪为例）3000公斤以上。当土壤中速效氮、磷、钾及微量元素较低时，就应首先选择底施这些肥料。有条件的地方，各种肥料作底肥的具体用量可土壤化验结果确定，一般高肥力土壤上氮肥总用量的30%底施，中、低肥力土壤则有50-70%的氮肥作为底肥，磷、钾肥70%作为底肥，生物肥和微肥尽可能一次全部底施。
从肥料品种上看，氮肥中的碳铵、尿素，磷肥中的过磷酸钙、钙镁磷肥、二铵，钾肥中硫酸钾、草木灰，微肥中的锌肥、锰肥、硼肥等，都适宜作底肥。
从施肥方式上讲，一般底肥应施到整个耕层之内，即15-30厘米的深度。对于有机肥、氮肥、钾肥等，可以混合后均匀地撒在地表，随即耕翻入土，做到肥料与全耕层土壤均匀混合，以利于蔬菜作物不同根系层对养分的吸收利用。磷肥由于移动性差，应集中施于垄（或畦）下，可使磷肥均匀分布在根系密集层里。
下面以丝瓜为例简要说明底肥的具体施用：
定植前整地施肥，亩施充分腐熟鸡粪3000公斤生物肥100公斤，尿素20公斤，过磷酸钙50公斤、硫酸钾30公斤、硫酸锌2公斤、硼砂1公斤。将鸡粪、生物肥、尿素、钾肥混合后普施（全面撒施）1/2，深翻30厘米，耙平，然后按要求行距开定植沟，并将剩余1/2粪肥与磷肥和微肥混匀施入沟内，使肥土混匀，在沟内浇水造墒，水渗下后合垄。
