一、复合肥肥效长，宜做底肥
经过加工造粒的复合肥比粉末状肥分解缓慢，不易流失和挥发，肥效持续时间长，易做底肥使用，一般亩用量为30公斤～40公斤。不要用于苗期追肥和中后期追肥，避免贪青晚熟。
二、复合肥分解较慢，应注意与单质氮肥配合使用
作物幼苗期需要氮肥量较大，因此，对播种或移栽时用迟效复合肥做底肥的作物，应根据不同作物的需肥规律，及时补施速效单质氮肥，一般苗期追施尿素5公斤～8公斤／亩。
三、复合肥浓度差异较大，应注意选择合适的浓度
目前，多数复合肥是只按照某一区域土壤类型平均养分状况和大宗农作物需肥比例配制而成，市场上有高、中低浓度系列复合肥，一般低浓度总养分在25％～30％之间，中浓度总养分在30％～40％之间，高浓度总养分在40％以上。要因地域、土壤、作物不同，选择使用。有条件的地方，应取土化验，结合作物的需肥规律，选用经济、高效的复合肥，以提高肥料利用率。
四、复合肥浓度较高，应避免种与肥直接接触或种、肥混用
复合肥养分含量高，若与种子或幼苗根系直接接触，会影响出苗甚至“烧芽”、“烂根”。播种或移栽时，种（苗）的根系与穴施、条施复合肥应相距5厘米～10厘米左右。切忌直接与种（苗）同穴施，造成“肥害”。
五、复合肥配比原料不同，应注意养分成分的适用范围
不同品种、不同浓度复合肥所用原料不同，生产上要根据土壤类型和作物种类选择使用。含硝酸根的复合肥，不要在叶菜类和水田里施用；含铵离子的复合肥，不宜在盐碱地上施用；含氯化钾或氯离子的复合肥不要在忌氯作物或盐碱地上使用；含硫酸钾的复合肥，不宜在水田和酸性土壤上施用。否则，将降低肥效，甚至毒害作物。
六、应注意与有机肥配合使用
长期大量使用化肥，会导致土壤中有机质消耗大于补充，含量不断下降。复合肥属于化肥类，连续使用，不利于培肥地力，不利于土壤理化性状改善。因此在使用复合肥时，要与农家肥配合，一般在每亩施用1000公斤～1500公斤优质农家肥的基础上，根据目标产量再增施复合肥为宜。
