预防甘薯烂窖，应采取以下三措施：
一、把好入窖前旧窖消毒关一般在甘薯收获前10天左右，进行消毒处理，以消灭潜伏在窖内的病菌。①刮去窖壁陈土3.3厘米，使见新土；窖底铲除污土15厘米厚，清除陈土后，撒上一层石灰，窖壁可用石灰浆涂刷处理。②用硫磺熏窖。按每立方米用硫磺50克，点燃后封闭窖口，熏1-2天后，再打开通气孔。③窖内喷洒1%硫酸铜溶液或甲醛50倍溶液，也可用甲醛与高锰酸钾混合进行密闭熏蒸。④用200倍辛硫磷喷湿窖底和窖壁。
二、把好入窖后窖温控制关甘薯入窖贮藏约5个月时间，根据甘薯在窖内的生理变化，结合外界气候特点，应做好分段管理。甘薯入窖初期，外界气温高，薯块呼吸强度大，放出大量水汽、一氧化碳和热量。这时窖温高，在无病害或病害极轻的前提下应打开气窗、气眼降温散湿，当气温降至15℃时，再关闭气窗、气眼，使窖温稳定在11-14℃，相对湿度控制在80%-90%。入窖20天以后，即进入贮藏中期，薯块呼吸强度减弱，发热量少，外界气温逐渐下降，这时最容易受冷害。应采取保温防冷的管理措施。①贮藏量应达到贮藏总容量的70%左右，有30%活动空间。②若不是井窖应加厚窖壁，保持一米以上的厚度，否则不能保温。③薯块上盖麦秆或稻草，厚度在20厘米以上，可提高薯堆温度2-3℃，还可降低薯堆表层凝结水，避免长时间浸湿薯块造成薯块腐烂。④浅窖也要盖草和盖土层，保证窖温在11-14℃的正常温度。贮藏后期，是春雨较多的季节，应防止薯窖漏水和渍水。这时的晴天，应夜关日开窖门，阴雨天气关门保温，每隔1-2天要进窖检查，发现烂薯，立即拣出。晴天中午气眼通气，下午盖上气眼，保持窖温11-14℃。
三、严格把好病菌预防关为了防止甘薯烂窖，除及时收获外，严格选留无病斑、虫伤、裂口、破皮的入窖。在黑斑病、软腐病严重的情况下，应采取高温愈伤处理。薯块高温处理要求“两快一保”，即升温快、降温快、保温好。要求点火升温48小时左右，薯堆上层温度达到38℃，下层达到35℃时立即停火，然后保持温度在32-39℃之间48小时。48小时后，窖温迅速降到15℃，贮藏期温度保持11-14℃为宜(此法应严格掌握升温和降温，防止意外造成损失)。入窖前用50%代森铵200-300倍液，或抗菌剂200倍液，或50%甲基托布津或25%多菌灵500-1000倍液浸10分钟，晾干入窖可防黑斑病。对干腐病严重的贮藏窖，可用保温保湿愈合处理，即鲜薯入窖后马上封闭门窗、气眼15天。对茎线虫严重的薯块，收获后，三垄合成一垄，在田间用400-500倍辛硫磷喷湿薯块，然后晾干贮藏，对杀死薯块表面的线虫有良好效果。
