一般情况下，化肥储存有三种方式：仓库堆存、货棚堆存和露地堆放。在多余季节，一般应以仓库堆存为主。库内既要通风降温，又要干燥防雨防潮。肥料在仓库内的储存方法有大堆储存和袋装储存两种方法。对于吸湿性比较强的氮肥品种如硝酸铵，要采用袋存，避免大堆储存。其他品种的氮肥和磷、钾肥料，大堆储存的时间也不能过长，到了雨季，一般都要求袋装。包装要用双层袋，内衬塑料袋外包编织袋。无论是大堆散存还是袋装存放，为了避免结块，都要减轻储存压力，控制散堆与包堆的高度，如25-40公斤的大袋存放，以20袋一堆为适中高度。
选择货棚储存的方法在雨季要格外小心，货棚的地点要选择地势高、干燥、通风的地方，棚顶防雨。在多雨季节，露地堆放是不允许的。即使临时堆放也必须选择地势高、干燥、通风的地方，而且采取加盖苫布防雨等措施。专家提示：吸湿性是化肥结块的祸根；高温多雨季节化肥储存的关键是防潮。
