一般情况下，化肥储存有三种方式：仓库堆存、货棚堆存和露地堆放。在高温多雨季节，化肥储存应以仓库堆存为主（仓库堆存分为大堆散存和袋装储存两种），仓库内既要通风降温，又要防雨防潮。以吸湿性较强的硝酸铵为例，无论是大堆散存还是袋装储存，为了避免结块，都要减轻压力、控制散堆与包堆的高度等，若是40公斤的袋装储存，以20袋一堆为适中高度。若选择货棚堆存，堆放地点应选择在地势较高、地面平整、不易积水的地方，化肥下面应铺上苇席及塑料薄膜以隔水防潮，化肥上面应用塑料薄膜覆盖，同时架设棚顶、加盖苫布以防止雨淋。
按化肥吸湿性的强弱，可分为三种：一是吸湿性强的化肥，如硝酸铵、硝酸钙、硝酸钠、碳酸氢铵以及一些微量元素肥料，这类化肥对储存条件要求严格，应避免大堆储存，包装要用双层袋，内衬塑料袋，外包编织袋。二是有吸湿性的化肥，氯化铵、硫酸铵、氯化钾、硫酸钾、过磷酸钙、尿素、磷酸铵、石灰氮等，这类化肥对储存条件有一定要求，也应注意防潮。三是吸湿性小的化肥，如磷矿粉、骨粉、石灰石粉和石膏等，这类化肥对储存条件要求不严，但原则上讲，任何化肥都应存放在干燥阴凉的仓库里。
