所谓黄瓜根系生理性死亡是指黄瓜侧根及毛细根量明显减少，根系木质部变褐或腐烂，明显死亡的根系经过一段时间恢复还能生出侧根，黄瓜根系在整个生育周期内有两次明显的生理性死亡。
第一次生理性死亡是在开花后15—20天至第一果实收获时。此期，植株养分开始向生殖生长供应,由于果实截留了部分营养，使得根系不适应这种变化，因而植株侧根及毛细根发生量有所减少，后期管理不当可导致部分根系变褐或腐烂。生产上可以采取如下预防措施：根瓜采收前促根促秧让植株平衡生长；根瓜及早采摘，以免坠秧；根瓜采收前后加强肥水管理。
第二次生理性死亡约在腰瓜采摘中后期,即植株生长期达100天左右时开始。植株经过前期旺盛结果，此时开始步人生长后期，根系开始逐渐衰退,根量明显减少,上部叶片颜色变浅,龙头伸长速度减慢,茎细弱,植株生长明显减缓。如若管理不当,将严重影响后期产量,使植株提早拉秧。生产上可以采取如下预防措施：1.增施有机肥,改善土壤的团粒结构,为根系的生长提供良好的条件。2.保护地生产应中耕,疏松土壤,增加土壤中的含氧量,促进根系再生。3.调节植株营养生长与生殖生长的关系,栽培上此期不可以让植株坠大瓜,瓜条长成即采收,必要时可进行适当疏瓜。4.加强植株营养及病虫害防治,及时进行叶面追肥,快速补充植株营养。叶面追肥可随病虫害防治同时进行,7～10天1次,可选用氨基酸叶面肥、糖醋液(糖1份、尿素1份、磷酸二氢钾1份、醋2份)50～100倍液。待新根大量发生,再逐渐转入正常管理。5.喷施生长素,促进新根快发,可用0.1%萘乙酸水剂600～800倍液喷雾1次。6.水分管理上以见干见湿为宜。
