黄肉桃病虫害主要有桃炭疽病、桃褐腐病、桃蛀螟、梨小食心虫、桃蚜、潜叶蛾等。病虫害预防应积极贯彻“预防为主，科学防控”的方针，以农业和物理防治为基础，提倡生物防治，按照病虫害的发生规律，科学使用化学防治技术，有效控制病虫害。
1、黄肉桃炭疽病的防治：
桃树生长期应以磷钾肥和有机肥为主，尿素为辅。及时排灌水，合理修剪，改善通风透光条件，秋季做好清扫果园工作。剪除病虫枝、枯死枝，并摘除僵果，清园后喷洒1遍3～5°Bé的石硫合剂。春季萌芽前（3月初），喷3～5°Bé石硫合剂，花前花后用10%世高800～1000倍液喷施，在初果期和果实膨大期内，用10%世高800倍液，或80%代森锰锌600～800倍液喷雾。
2、黄肉桃褐腐病的防治：
消灭越冬菌源，结合修剪做好清园工作，消除僵果、病枝，集中烧毁，进行翻土，将地面病残体深埋地下。合理修剪，通风透光，多施有机肥增强树势，及时防治害虫害，有条件的套袋。桃树发芽前喷5°Bé石硫合剂，落花10天后喷65%代森锰锌可湿性粉剂500倍液，或50%多菌灵1000倍液，果实期可喷50%扑海因可湿性粉剂1 000～2000倍液。
3、黄肉桃桃蛀螟的防治：
在果园四角或四边栽植引诱植物，如向日葵（早晚熟都有）,诱集成虫集中在花盘上产卵，减少对果树的危害。悬挂糖醋罐、性引诱剂等诱杀成虫，糖醋水配制为水﹑红糖﹑醋﹑敌百虫比例为10∶6∶3∶0.1。果实套袋，防止成虫产卵其上以及危害果实。在成虫产卵高峰期及孵化盛期，喷50%杀螟松乳剂1 000倍液，或2.5%溴氰菊酯乳油5 000倍液防治。注意敌敌畏、乐果、敌百虫在桃果硬核前喷施有强烈的疏花疏果作用，为硬核前的禁用药；波尔多液在桃树上使用，能造成桃树叶片严重穿孔和大量落叶；桃树对石硫合剂敏感，生产上多在发芽前使用
4、黄肉桃蚜虫的防治：
防治蚜虫，勤观察，一旦发现虫口密度上升应立即防治，为减少用药次数可合并用药，即喷吡虫啉1000～1500倍液+高效氯氰菊酯1000倍液+多菌灵800倍液。
5、黄肉桃细菌性穿孔病的防治：
3月上旬喷1次3～5°Bé石硫合剂。3月中下旬桃花露红期，喷1次吡虫啉1000倍液+高效氯氰菊酯1000倍液+多菌灵600-800倍液。应在关键期用药，并要求树体里外喷透，叶面正背面兼顾，以背面为主；雨季用药可加入增加附着力的助剂，如助杀等。
6、农药防治禁忌
注意敌敌畏、乐果、敌百虫在桃果硬核前喷施有强烈的疏花疏果作用，为硬核前的禁用药；波尔多液在桃树上使用，能造成桃树叶片严重穿孔和大量落叶；桃树对石硫合剂敏感，生产上多在发芽前使用。
