1、挑选要严格 红薯贮藏时间较长，多达4～5个月，入窖前，一定要严格挑选，剔除破伤薯、病虫薯、裂薯及受冻薯等。入窖前要在窖底和窖四周铺垫干草。
2、初期要发汗 入窖后的20～30天内称发汗期，要以通风、降温、散湿为主。因初期薯块呼吸旺盛，窖温较高，湿度也大，必须注意通风散热，不要封闭窖门。待到窖外气温接近10℃时才可以封窖，使窖温稳定在12～14℃，相对湿度保持在80%左右。
3、中期要保温 入窖后的30～40天至翌年温度回升之前称越冬期，管理工作要以保温防寒为中心。因此阶段薯块呼吸减弱，发热量少，外界气温又低，因此，窖外必须加厚土层，严封窖门；窖内要盖草保温，保持窖温在12～14℃之间，并要防止雨雪渗入和老鼠为害。
4、后期要通风 开春以后，气温回升之时称为回暖期。窖内经过冬季封窖，氧气缺乏，薯块生活力有所降低，如遇高温很容易感病，并会迅速蔓延。这个阶段管理工作要以通风换气、稳定窖温为主。在保持窖温12～14℃的前提下，减少覆盖，逐渐打开窖门，加强通风换气，保持薯块正常呼吸。但此时的天气时冷时热不稳定，随时注意保温和散热。
在贮藏期间要注意两点：一是勤检查，发现烂薯及时剔除；二是下井窖前一定要用灯试验，如火不灭，才能进窖，防止二氧化碳中毒。
