埋藏法 在贮藏窖或室内，先铺6～9厘米的干沙子，摆放20～30厘米厚的无病、无虫、无机械损伤的辣椒，再铺放9～12厘米的沙子。如此堆放1～3层。也可用筐或木箱装辣椒，离箱、筐上口5～7厘米处覆盖湿润的泥沙。把筐、箱堆4~5层，在最高层覆盖30厘米厚湿润的泥沙。窖贮或室内保持贮藏适温，可贮藏50～60天。
窖藏法 选土质坚实、地势高燥的地块，挖地下窖。窖壁要坚实，底垫砖块，窖口要塑料薄膜封闭，防止雨淋和冻害。辣椒在窖内的存放形式有：
1.筐贮：将挑选好的辣椒放在筐中。筐内垫纸或薄包，装后加盖。将筐堆垛。2.架贮：在窖内做成1～2米高的架子，分成3层。将辣椒平铺在架上。3.散藏：在地面铺上稻草，上放辣椒30厘米厚，堆成一长条，上盖草苫子。窖内的蒲包、草苫子等均应保持湿润，并保持窖温7℃～9℃。每15天可检查1次。
塑料薄膜气调贮藏法 将经过挑选的辣椒装入消过毒的板条箱内，每箱装10公斤左右，按“丁”字形堆放。每垛堆48箱。最上层覆盖麻袋或牛皮纸等，底层放生石灰5～7公斤，以吸收二氧化碳。外层罩上塑料膜帐子，密封隔绝外界空气后，即抽氧充入氮气。一开始把氧含量降到2%～5%。经数天后，将氧调节在5%以内。呼吸产生的二氧化碳，用增加消石灰的办法吸收，使其含量也控制在5%以内。每隔10～12天揭帐倒动1次，擦干薄膜上的水滴，剔除腐烂果实。
