适宜蒜薹贮藏的温度一般在0~0.8℃，空气的相对湿度为85%~95%。蒜薹贮藏保鲜的方法有：
冷藏法 将蒜薹充分预冷后，装入筐或板条箱内，或直接堆垛在贮藏的货架上，使库温控制在1℃左右。
冰窖贮藏法 此法适合于北方产地。窖的四周用70厘米×40厘米的冰砖做成隔层。再将湿蒲包的蒜薹和冰砖做成隔层。再将装入湿蒲包的蒜薹和冰砖隔层码放3~5层，最上面再压一层冰块，缝隙用碎冰砖填满，最上面用1米厚的稻壳封顶。此法简便易行，但需消耗大量的冰块及人力，且翌年的腐烂率达20%~40%。
气调法 1.快速降氧法：将蒜薹堆好并用塑料帐封后，连续抽氧灌氮3~4次，将帐内含氧量降到1%~3%，在贮藏过程中使帐内含氧量控制在3%、二氧化碳在10%左右为好。2.自然降氧法：蒜薹进帐后，立即将塑料帐密封，帐内的氧气由蒜薹自行吸收，使氧分压逐渐降到2%~4%；以后每天测定调节，使氧分压保持在所需要的范围内。3.充二氧化碳法：在蒜薹堆好并用塑料帐密封后，先吸出帐内少量气体，使帐内氧气与二氧化碳含量基本相同。随着帐内含氧量的下降，应用消石灰吸收二氧化碳，使其相应下降，以后含氧量宜控制在1%~3%，二氧化碳10%。4.小包装气调贮藏法：用100厘米×75厘米的聚乙烯薄膜袋装入15~20千克的蒜薹，扎口密封。库温控制在-0.5~0.5℃，当袋内氧气浓度达1%、二氧化碳浓度达12%~15%时，应松开袋口通气。贮藏后期每7~10天通气1次，通气时若发现袋内有积水，应用干净毛巾擦干。这种方法可贮藏蒜薹8个月以上。
硅窗袋封法 可用硅窗保鲜袋、硅窗保鲜帐、活动硅窗大帐等多种方法实现自由调节袋内气体成分达到理想水平，库温在-0.5~0.5℃，氧气浓度2%~5%，二氧化碳浓度3%~8%，蒜薹贮藏期为8个月。
塑料大帐气调贮藏法 将预处理好的蒜薹放在竹筐或竹架上，帐底放入消石灰（每10千克蒜薹放0.5千克消石灰）吸收二氧化碳，密封后充入氯气，把氧气浓度降至5%，每1~2天测一次气体浓度。在库温为0℃、氧气不低于2%、二氧化碳浓度不高于5%、空气相对湿度90%的条件下，蒜薹贮藏时间达8~9个月。当氧气的浓度降到2%时，打开大帐两头预先做好的筒形袖口通入空气。如果二氧化碳浓度高于8%，可通过袖口放入生石灰包，吸除过多的二氧化碳。
