对大面积条纹叶枯病抗性较弱或没有抗性的水稻品种而言，防病重点在于避免或减少灰飞虱传毒。麦收前后是一代灰飞虱由麦田向水稻秧田大量迁移并传毒的高峰期。在生产允许的情况下，可以适期推迟播种，结合使用抛栽、肥床旱育等轻型栽培措施，将播种期推迟至５月15日左右甚至更迟，以后采用中苗移栽或小苗抛栽的办法。这样能有效避开一代灰飞虱迁飞传毒高峰。另外，尽量选择虫源量少、周围环境清洁的田块作秧田。有条件的可将秧池集中连片，避免在麦田田头一家一户孤立育秧。药剂浸种对苗床早期带毒灰飞虱有一定的防治效果，每公斤稻种用吡虫啉0.8克以上（有效成分），也可以用锐劲特浸种。药剂浸种还能兼治秧田期螟虫等其他害虫。在水稻秧田期和移栽大田前期，抓住灰飞虱传毒高峰期适时用药防治灰飞虱。锐劲特是防治灰飞虱的首选药剂，一般每亩用５％锐劲特30毫升，可兼治三化螟、稻蓟马。每亩用10％吡虫啉40克或５％高效大功臣可湿性粉剂20克，对灰飞虱也有很好的防治效果。生产上应有组织地在较大的区域内对灰飞虱进行统防统治，以取得最佳的治虫控病效果。在水稻条纹叶枯病重发区，应尽量选用抗耐病水稻品种，如泗稻10号、盐粳５号、盐粳６号、盐粳７号、盐稻８号、淮稻６号、淮优粳２号、徐稻３号、镇稻88、镇稻99、扬粳9538等，或改种抗性强于粳稻的优质籼稻品种两优培九、汕优559等。
