①幼年树的修剪。幼树经常利用腹芽和顶芽优势的特性，进行抹芽控梢，以促进幼树多抽新梢，培养大量结果母枝。抹芽控梢的方法是：
当夏秋季抽梢达2～3厘米时，进行手工抹除，“去早留齐，去少留多”，每3～4天1次。在一定时间内，嫩梢会越抹萌发越多，坚持15～20天后，大部分的末级枝梢都有3～4条新梢萌发，此时即可停止抹梢，让新梢生长，称为放梢。为使新梢整齐，在放梢前一天，抹芽要彻底，对萌发不久的短芽亦要抹除。此外，对于高部们的应多抹1～2次或迟4～7天放梢，让部位低的新梢长得长些，经几次梢期的调节，逐步使树冠平衡。一般情况下每年放春、夏、秋3次梢，于6月上中旬放夏梢、8月上中旬放秋梢，定植后第3、4年结果。
对下一年准备结果的树，要注意适时放秋梢和控制夏梢的数量。因秋梢生长数量和质量与夏梢有关。夏梢过迟放梢，萌发的数量多而短弱，秋梢数量亦相对减少。夏梢萌发的数量适中、壮健，则秋梢数量增多。一般有40%～50%的春梢萌发多条夏梢时可放梢，而秋季要有70%～80%基枝萌发多条秋梢才可放梢。放梢必须紧密配合施肥，在放梢期前20～30天应施腐熟的有机肥，使在放梢前半个月即有部分嫩芽可抹；再在放梢前10天施速效氮肥，促使新梢萌发多而密；放梢后要根据植株新梢的强弱适当施肥，特别是秋梢的壮梢肥不能过多，否则会促发晚秋梢或冬梢。放梢期间最好是有阵雨的阴凉天气，土壤水分要充足。如干旱酷热应避免放梢，重点防治潜叶蛾。当夏秋梢长至5～6厘米时，如枝梢过密，要及时疏梢，每基梢留2～3条(秋梢可多留些)。留梢过多，新梢短弱；留梢太少，新梢趋向徒长。红肉蜜柚的秋梢长度以20～30厘米为宜。冬梢应一律抹除。
②结果树的修剪。结果树修剪因树龄、结果情况和修剪时期而异。冬剪在采果后至春芽发前进行。一般在采果后即可开始修剪，中高海拔地区宜在春季萌发前进行。冬剪主要是疏剪枯枝、病虫枝、衰弱枝、交叉枝、衰退的结果枝和结果母枝等，调节树体营养，控制梢果比例，对一些枝条也行适当回缩修剪，促进结果母枝多而壮，保证连年高产。
初结果期要保证树冠发育良好、结果母枝迅速增加和防止落果。要保证初结果树树冠继续发展良好，继续选留主枝、副主枝的延长枝，保证斜直向上生长，并适当疏去其上着生的果实，加快树冠形成。横斜生长的骨干枝的延长枝，亦尽量减少其结果，使树冠向四周扩展。剪除内膛及顶端过密的夏秋梢，基部留取1～2个叶片，以供萌发春梢结果母枝，余者剪除。树冠外围的枝条适量选留夏秋梢，每个枝条上留1～2个斜向生长的夏秋梢，以加速树冠形成。树冠内部、下部枝条尽量保留，让它开花结果，剪除离地面30～40厘米以下的结果母枝，以减少近地面的果实感染炭疽病。
短截春梢(留15厘米)和抹除夏梢是防止落果、增加有效结果母枝和减少病虫害的有效措施。
成年结果树为求树冠立体结果，主枝开心圆头形树冠要使树冠保持波浪形，有“天窗”，树间保持适当距离，突出树冠中部的枝条应剪除，以免遮光导致下部枝条枯死。上下左右枝条不应互相重叠交叉，树冠内部透光良好。自然开心形树冠要注意对树冠内部的徒长枝适时进行摘心、短剪或删除；树冠顶部过强过密时，则剪除强枝或适当删疏，以保持树形。
树冠下部枝条与邻树交叉时应适当剪短，如下垂过低，有碍耕作，应予删除。需利用的徒长枝，应适时摘心或使弯垂，不需用的及时删除。采果后的结果枝若细长、软弱、叶片黄化或无叶，可从结果枝基部删除；如结果母枝衰弱，可从结果母枝基部删除。树冠内膛应剪除枯枝、细长弱枝、病虫枝和徒长枝。结果树的修剪以疏删为主，结合短截、回缩，删除交叉枝、过密枝，回缩过长枝。
枝干与果实都消耗同化物质，据推算5～30年生柑橘树枝、干、根消耗的同化物质为果实消耗的3～10倍。青壮龄树叶面积增加快，产量高；进入一定树龄，叶面积便停止增加，而枝干仍逐步增大增多，分枝级数也越来越高，养分运输距离越来越长，消耗于枝干的同化物质逐年增多，用于果实方面的则逐年减少，枝梢生长力转向衰退。如果植株相互挤迫，树冠郁闭，则新枝叶发生少，树冠内部、下部枝叶枯死，加速衰退，果实产量迅速降低。因此，红肉蜜柚树枝干所占比重不能过大，要及时更新枝条。每年都应对一部分生长较衰弱的枝组进行回缩修剪，缩短养分运输距离，减少无用消耗，并改善光照，使光线透入树冠内部和下部，增加新枝叶，复壮树势。
冬剪在采果后至春梢发芽前进行，视当地气候冷暖而异。从基部疏除多余的主枝、副主枝和侧枝，每年疏删1～2个。回缩树冠顶部过高枝组及株行间交叉的骨干枝先端或枝组，保持树高在3.5米以下，株行间有20厘米以上的空间。剪除直立性强势枝组和徒长性枝条，以及影响光照的密生枝组和枝背下的衰弱枝组。分年对枝径1～2.5厘米的枝组进行回缩，对密生枝组或弱化枝组留桩5～15厘米进行短截，下垂枝组在骑马枝或枝组前回缩，光秃的留5～10厘米短截，每年回缩修剪的数量为枝组总量的25%～30%。
夏剪一般在5月下旬进行。删除过密、多余的主枝、副主枝和枝组，回缩不结果、互相遮盖的长枝、交叉枝。抹除夏梢，控制秋梢生长。
③衰老树的更新复壮修剪。衰老树发枝无力，结果甚少或部分枝梢干枯，应及时更新复壮，提高产量和延长经济寿命。酌情采取主枝更新、露骨更新或轮换更新。树冠更新后的管理是成败的关键，应做好防晒、疏芽、肥水管理和病虫防治工作。
