土壤是病虫害传播的主要媒介，也是病虫繁殖的主要场所，许多病菌、虫卵和害虫都在土壤中生存或越冬，且土中还存有杂草种子，因此不论是苗床、盆花用土，使用前都应彻底消毒。常用的土壤消毒法有：
1、日光消毒。将配制好的培养土放在清洁的混凝土地面上，薄薄平摊，暴晒3—15天，即可杀死大量病菌孢子、菌丝和虫卵、虫、线虫。
2、蒸气消毒。把营养土放入蒸笼内，加热到60—100℃，持续30—60分钟，加热时间不宜太长，以免杀死能分解肥料的有益微生物，影响花卉的正常发育。
3、水煮消毒。把培养土倒入锅内，加水煮开30—60分钟，然后滤去水分晾干到适中湿度即可。
4、火烧消毒。在露地苗床上，将干柴草平铺在床面上点燃，这样不但可消灭表土中的病菌、害虫和虫卵，翻耕后还能增加部分钾肥。
5、药剂处理。
（1）甲醛(福尔马林)。每平方米用50毫升甲醛，加水6—12升，或每0．1平方米用40％甲醛40毫升，加水1—3公斤。播前10—12天用喷雾器喷洒在播种地上，再用薄膜严密覆盖，勿使通风，播前一周揭开，使药液挥发。对砂石类基质可直接用50—100倍甲醛液浸泡2—4小时，排除药液后再用清水冲洗2—3遍。
（2）多菌灵。每立方米培养土施50％多菌灵粉40克，拌匀后用薄膜覆盖2—3天，揭膜后待药味挥发掉即可。
（3）代森锌。每立方米培养土施65％代森锌粉60克，拌匀后用薄膜覆盖2—3天，再揭去薄膜，待药味挥发掉使用。
（4）黑矾(硫酸亚铁)。雨天用细于土加入2％—3％的黑矾制成药土，按每平方米100—200克撒入土中。或配成2％—3％的溶液，每平方米用9升。
（5）百菌清。每平方米用45％百菌清烟剂1克熏棚5小时。
（6）辛硫磷。苗圃土壤地下害虫严重时，可亩用50％辛硫磷100克，加饵料10公斤制成毒饵，撒在苗床上诱杀。
（7）敌百虫。苗圃土壤地下害虫严重时，可用90％敌百虫晶体500克，加饵料50公斤制成毒饵，撤在苗床上诱杀。
消毒时操作人员要戴上口罩和手套，防止药物吸入口内和接触皮肤，工作后漱口，并用消毒液(或肥皂)清洗手脸。
