水稻病虫害防治主要对象是螟虫、稻飞虱、稻瘟病、纹枯病、稻瘿蚊等病虫，重点推广综合防治技术，即以水稻为主体，采取以农业防治为基础，合理使用农药，保护利用天敌的方法，使各项防治措施配套，从而提高总体控制效果，最大限度地减少化学农药的使用量，达到经济、安全、有效的目的。
预防措施
在三化螟、稻瘿蚊发生区，要合理安排茬口，减少混栽面积，减少害虫辗转为害的桥梁田，因地制宜调节播种期、插秧期等防避措施；提早浸春沤田，降低越冬二化螟、三化螟成活率；针对当地的主要病虫害，选用抗、耐病虫性好的品种；做好种子消毒处理，旱育秧田应用广枯灵进行土壤处理，预防苗期病害发生；结合水肥管理等健身栽培技术，增强稻株抗病虫能力。
合理用药
根据基层病虫预测预报，通过田间调查，以防治指标为依据，采取治小面积（秧田），保大面积，治前控后，抓住重点，兼顾一般等策略，选择对路农药。防治稻瘟病用三环唑、稻瘟灵、灭病威；防治纹枯病用井岚霉素；防治白叶枯病、细菌性条斑病用叶枯宁或叶青双；杂交稻穗期病害如稻叶尖枯病、稻曲病、云行病、鞘腐病、粒黑粉病和叶黑肿病等可用粉绣宁或40%禾枯灵；防治稻飞虱选用吡巴丹、B.t等；防治稻瘿蚊选用益舒丰等。
稻瘟病、稻曲病、稻瘿蚊用药时间特别重要。防治稻瘟病在水稻破口期（10%的稻株破口）；稻曲病在水稻破口前3～5天用药；防治稻瘿蚊，秧田期在播种后5天、本田期插秧后5～7天施药。
在稻田中禁止使用拟除虫菊酯类及其混配农药，严禁在水稻后期使用甲胺磷等剧毒、高毒农药；在水稻前期要谨慎使用三哗磷等有机磷农药防治螟虫，以免引发水稻后期飞虱的暴发。
