谷子黑穗病分粒黑穗、腥黑穗和轴黑穗3种，它们的症状和侵染规律各不相同。
1症状上的区别
1．1粒黑穗。通常全穗发病，也有部分籽粒被害而造成全穗病健粒混生的。病株与健株相比，病株略矮，出穗稍晚，后期病穗仍直立。病穗较狭长或短小，个别病穗成短粗状，失去正常穗形。病穗初为灰绿
色，后期变为灰白色，病粒变为小灰包，比正常籽粒稍大，卵圆形或圆形，外包灰白色被膜，内部充满黑褐色粉末，是黑粉菌的冬孢子。病穗较健穗重量减轻。
1．2腥黑穗。仅为害个别籽粒，谷子抽穗后仅有少数籽粒发病，其它籽粒健康。孢子堆长圆锥形或卵圆形，最大的比正常谷粒长几十倍。冬孢子堆突出到外颖的外面，极为醒目。冬孢子堆外膜初呈绿色至
深绿色，后变墨绿色。一个病穗上病粒l～5个，多到20个，后期破裂散出黑褐色冬孢子。
1．3轴黑穗。为害穗部，散生，内部充满黑粉，为病原菌的冬孢子堆。一个穗上只有部分籽粒被害，被害籽粒外颖不受破坏，冬孢子堆不明显突出，病粒比健粒稍大，病粒中偶见有中轴。冬孢子堆生于子房中，全穗子房被侵染，被害子房肿大为圆形，长期包于颖壳中，呈青灰色外观，里面包藏黑褐色粉末状冬孢子堆。
2侵染过程的区别
2．1粒黑穗病是系统病害，从病穗里分散出来的粘附于种子表面的冬孢子，成为第2年发病的主要侵染源。第2年春季播种未经消毒的带菌种子后，萌芽的冬孢子便从谷子幼苗的胚芽鞘部位侵入幼苗，并随着生长点向上生长，进而到达分化的花序里,最后侵入幼嫩的子房里，破坏子房，形成大量的冬孢子，使谷穗变为黑穗，完成侵染发病过程。
2．2谷子腥黑穗病和轴黑穗病都是非系统侵染，不经种子和土壤传播，于谷子开花时从花器侵染子房，当年侵染发病。谷子开花期雨量较多年份发病率高，干燥年份发病率低。诱发病害的环境因子是谷子开花期的日照时数及相对湿度。曰照时数少和相对湿度大时会延长开花期，增加病菌的侵染机会，发病率就高。
