油菜菌核病从苗期到成熟期都可发生，以终花期至接近成熟期发病较重，菌核病危害油菜叶片、叶柄、茎秆、花和荚，以茎秆发病较重。感病植株的叶片、茎秆、花瓣常易腐烂，病荚往往提早枯死，茎秆腐烂而造成大量倒伏。一般发病株率为10%~30%，严重时达80%。因此，春后，必须采取综合有效的防治措施，以达到确保高产的目的。
预防菌核病的主要方法：
1、春后清沟排渍。开春后雨水增多，要及时清理沟渠，做到沟沟畅通，降低田间湿度，防止土壤渍水闭气而造成烂根。
2、中耕松土，消灭子囊盘。开春后，应抓住晴天及早进行中耕松土，在2月下旬至3月上旬，田间浅锄两次，既能控制杂草生长，又能深埋菌核，破坏子囊盘，还能改善土壤的通透性，有利于油菜春发稳长。
3、花期摘除黄叶。油菜花期是油菜菌核病最易浸染的时期，加上越冬菌核的病菌子囊孢子释放与花期吻合时间长，因而子囊盘形成的高峰期与病叶增长的高峰期往往处在同一时期，在油菜终花前后分次将主茎1.2米以下的长柄叶、短柄叶和主茎低位无效叶等 “三叶”摘除，中断病菌的再浸染，使其无法侵入茎秆，从而起到预防的作用。
4、控施氮肥，增施磷钾肥。
5、及时防治。在盛花期和终花期病茎株率达1%或病叶株率达10%时，每亩用40%灭病威150毫升或25%多菌灵200克对水50公斤各防治1次。
6、科学收割。油菜菌核病有50%~90%集中在茎秆基部12~15厘米，在重病区和重病田必须改进收割方式，将枯株连根拔起，不让菌核脱落田中，以减少土壤中菌核残留量，尽可能将茎秆作高温堆肥或作柴烧掉，能有效降低下年油菜菌核病的发病率。
