玉米丝黑穗病是玉米种植区最常见的一种病害，也是一种多发病害。它是由真菌引起的系统性病害。玉米在雄穗抽穗后，小花基部彭大，或花器变形，内有黑粉。有的雌穗变短，变粗，初苞叶外，整个果穗为一包黑粉和散落的丝状物。应选育抗病品种为基础，结合农业措施与药剂处理进行综合防治。
提高种子质量，选育抗病品种。积极推广对玉米丝黑穗病具有良好抗性的品种，是解决玉米丝黑穗病为害最直接有效的方法。
实行轮作 。重病地实行三年以上轮作，可与大豆、蔬菜、马铃薯、油料等作物轮作。
施用无菌肥。防止用带菌的秸秆作饲料，施用经过发酵的有机肥料。
及时拔除病株，消灭菌源。无论是苗期、中期，还是玉米抽穗后，发现病株，及时拔除。力争在菌源未扩散前拔除病株，带到田外深埋或烧毁，收获后对病残组织也要及时处理，压低菌源。
精耕细作，适时播种。创造有利于幼苗出土的条件。
药剂防治。播前药剂拌种。用12.5%烯唑醇可湿性粉剂按种子量0.2%拌种。此外，选用15%粉锈宁可湿性粉剂或50%甲基托布津粉剂按种子重量的0.3%～0.5%拌种，效果也较理想。
