作物病害按照其病原体分类，可分为真菌性病害，细菌性病害，病毒性病害，线虫性病害和一些寄生性植物引起的病害。而寄生性植物引起的病害我们可以肉眼识别其寄生植物。真菌性病害和细菌性病害各有其特有的病状和病症，而最根本区别是病症。
依据病症肉眼辨别
细菌性病症： 一般来讲，菌脓是细菌性病害所固有的病症，大部分伴随臭味。如植株迅速死亡而叶片仍为绿色是青枯病，为细菌性病害。
真菌性病症： 真菌性病害的病症则在其病状周围或发病部位，如出现黄萎或枯萎、霉状物如霜霉病在叶子背面附有黑色或白色霉层，叶霉病则在叶背长出灰紫色至黑褐色霉层、点状物、锈状物、粉状物、菌核，如菌核病，白绢病等。
病毒类病害： 病毒类病害包括由类菌原体、病毒、类病毒引起的病害，其病状表现出黄化(如柑桔黄龙病)、卷叶或花叶(如黄瓜花叶病毒病)为主，少数沿茎秆或果实成条斑状(如番茄病毒性条斑病)。
通过气候条件识别
病毒病一般是高温干旱条件下发生为多；细菌病害大多是在大风大雨过后发生(因其病原主要是从伤口侵入)；真菌性病害的不同类型的真菌病原体在不同的气候条件下发生。
通过植株的发病部位识别
有些病害只发生在叶片，如叶霉病、叶斑病等；有些只发生在茎秆或茎基部上，如番茄青枯病发病部位是茎基部往上的茎秆上，而茎基腐病只发生于茎基部。
