1、农业防治措施：一是实行轮作，与禾本科作物实行5或6年以上轮作。
2、增施肥料：增施底肥和种肥，增强植株抗病力；叶面喷肥对增强植株抗病也有明显效果。或增施有机肥和绿肥可以改良土壤性质，促进大豆健康生长，提高抗病力，而且能促进土壤中的有益微生物的增长，可减轻孢囊线虫的危害，增加大豆产量。
3、选种抗病品种：是孢囊线虫重发生区最经济有效的防法。
4、药剂防治措施：一是用大豆种衣剂包衣处理，药种比为1：75；呋喃丹颗粒剂每公顷75~90公斤，或5%涕灭感颗粒剂每公顷40~60公斤。药同种肥35%的甲基硫环磷按种子量的0.5%拌种。
5、田间防治：苗期喷硼钼微肥或大豆黄萎叶喷剂。
