1、加强植物检疫，防止危险性病虫草传入
在确保危险性病虫杂草不传入的前提下，积极引进推广优质高产抗病良种。
2、选种优质高产抗病良种
因地制宜，大力推广优质高产抗病水稻良种，注意提纯复壮，逐渐替换丧失抗病性的品种，中北部稻区选种滇杂35、滇杂36、滇杂86、保粳杂2号、粳两优7639等，常规稻选种岫136-14、岫136-12、岫136-16、岫粳14、楚粳27、昌粳14号等；南部稻区选种深优9734、内香8518、内香8156、宜香1979、宜香3003、中优77、内5忧39、两优2161；常规优质稻选种滇瑞408、德优8号、滇陇201等。
3、保健栽培控病
实施良种良法配套技术措施，提高植株抗病能力，从而达到控制减轻发病和提高产量的作用。
⑴培育壮秧，适时早栽：采用旱育或湿润方式育秧，培育无病壮苗，增强秧苗抗逆性；在水源条件好的情况下，力争多栽小满秧，少栽芒种秧，以避过后期低温冷害。
⑵科学施肥，合理灌溉：底肥一般亩施腐熟厩肥1000-1500千克、NPK复混肥40千克、硫酸钾5千克、硫酸锌1千克；分蘖期结合除草亩施尿素5千克作分蘖肥，其余时期不再施用氮肥，冷浸田要注意增施磷肥；水浆管理上做到“浅水栽秧、寸水活棵、苗够晒田、深水孕穗、湿润灌浆”，通过合理灌溉，控制病虫发生条件，促进植株健壮生长，提高品种抗逆性。
4、减少病虫源基数
⑴处理病稻草：对病田稻草另行堆放，尽早处理；不用病草盖房、搭棚、捆秧；用病草垫栏的，要充分腐熟后才能施。
⑵种子消毒：选用10%浸种灵乳油2ml兑水10千克浸稻种6千克，浸泡72小时后捞出催芽播种，可预防恶苗病、干尖线虫病、白叶枯病；还可选用25%施保克乳油5ml兑水10-15千克浸种10千克，浸泡72小时捞出催芽播种，可预防稻瘟病、恶苗病。
⑶春季翻犁灌水灭蛹，降低虫源基数
翻犁复种小春作物的田块利用作物灌水达到灭蛹防治螟虫，小春作物收获后及时翻犁晒田，日光杀蛹或让天敌啄食；冬闲田应及早翻犁利用冬春雨水或灌水灭蛹防治螟虫，从而减少越冬虫源基数。
5、药剂防治
⑴稻瘟病：抓好秧田苗、叶瘟，本田叶瘟，中后期穗瘟防治。目前使用的药剂有75%三环唑、40%富士1号（稻瘟灵）、70%甲基硫菌灵、40%硫环唑。
⑵稻螟虫：苗期防治在卵块孵化盛期用药，预防白穗在水稻抽穗初期用药。常用农药有巴丹、三唑磷、杀虫双、杀虫单、特杀螟等。
⑶稻曲病：在水稻始穗期前7天至始穗期喷药，常用农药有井冈霉素、多菌灵、三唑酮等。
⑷稻白叶枯病：感病品种、常发病区秧苗三叶期防治；本田期对有零星发病中心的田块及时喷药封锁发病中心或全田防治。常用农药有叶枯宁、叶枯唑、农用链霉素。
⑸稻飞虱：2-3龄若虫盛发期虫口密度达1000头/百丛时喷药防治。常用农药有吡虫啉、吡蚜酮等。
6、其它防治措施
⑴施好“送嫁药”：水稻移栽前一周预防叶瘟及稻螟虫一次，减少秧田病虫带入大田，达到治早治小的目的。
⑵化学除草：秧田除草，旱育秧可在播种盖土浇透水后，亩用50%丁草胺100-150ml兑水40-50千克或用旱秧灵、施田补每袋兑水15千克喷洒秧床；湿润秧田，播种盖土后可采用旱育秧的除草方法，也可到二叶一心时用禾大壮或龙杀或快杀稗拌尿素或泥沙撒施防除。大田除草，往年草害特别大的田块可在移栽前用丁草胺除一次，移栽后7-10天结合施分蘖肥再选用扑草净或果尔或田毛等防除一次；草害稍轻的田块移栽后7-10天防除一次即可。
⑶养猫控鼠，药物灭鼠保苗保粮：大力发展家庭养猫防鼠，减少害鼠往返迁入农田的数量，减少稻谷损失；同时根据农田鼠情监测预报，在鼠害发生高峰期选用万分之五敌鼠钠盐或0.5%溴敌隆配制饵料进行统一灭鼠，特别要抓好水稻播种期、孕穗期、抽穗期至成熟期的防治。
⑷物理、生物防治：有条件的地方可采用频振式杀虫灯、太阳能杀虫灯进行稻田害虫成虫诱杀；推广使用昆虫性信息素诱杀害虫成虫；还可结合稻田养鸭、养鱼及生物多样性混合间栽技术防病、防虫、除草。
⑸抓好专业化统防统治：选择具有带动作用的乡镇组建水稻病虫机防队，在病虫发生关键时期进行统防统治，有效控制病虫扩展危害，提高防效。
