早稻旱育秧的施肥量要比水育秧高得多。由于一些农民掌握不好苗床期的施肥技术，每年都有肥害死苗的现象发生。
旱育秧肥害主要出现在3叶期前后、晴天气温高时。施肥类型、时机、方式不当都会造成肥害。秧苗施用的农家肥未经充分腐熟，有机物质在土壤半腐熟的过程中与幼苗争夺水分，局部高温产生高浓度的氨或有毒物质，造成对幼苗的毒害、灼伤甚至死苗；整地施肥不均，秧苗一叶一心后，秧根下扎触及肥团或肥塘，很容易被高浓度的肥液“烧”伤，导致秧苗地上部分生理失水死苗；播种前将化肥施于苗床土表面，造成种子萌芽后胚根灼伤，幼苗有芽无根，出现成片枯死；化肥作基肥施用过晚、用量大，施入秧苗的铵态氮未能转化为硝态氮供秧苗根系吸收，引起氨中毒烧苗；沿袭
水育秧的方法，在秧苗齐苗后一次性追肥过多或肥料施得不匀，或采用撒施后又不及时喷洒清水淋洗，导致秧苗成片或呈带状死苗，受害轻的也会因生长受阻而成僵苗或病苗，难以培育出壮苗。
要防止旱育秧肥害死苗，必须采取针对性措施。
选好苗床。选择靠近水源、地势高爽、土质肥沃、土壤通透性好的菜园或其他旱地作苗床。一般每插1亩大田需苗床10-15平方米，苗床土壤要达到肥、松、厚、软、细的要求。如用水田作苗床地，需要提早翻耕并铺垫大量的旱地肥土，加拌农家肥，土肥要拌和均匀，厚度要求在5厘米以上，不能出现肥团、肥塘。一般每平方米施充分发酵的农家肥10千克、氮磷钾各15%的复合肥100克、硫酸锌10-20克。
控制追肥。苗床培肥好的，一般不需要追肥。
见秧苗发黄，必须查找原因，不能见黄苗就追施氮肥，因为缺肥不是发黄的唯一原因，苗床湿度过高、水分过多、土壤板结等都可造成秧苗发黄。当秧苗生长偏弱瘦时，可在秧苗1.5-2叶期，施用少量“断奶肥”；在移栽起苗前3-5天，追施“送嫁肥”，或用0.5%-1%的尿素液在起苗前1天均匀喷施。
浇足底水。苗床整平后喷洒清水，使整个耕作层处于水分饱和状态。有的农户用干火土灰、干陈砖灰、干草木灰作营养土，容易出现营养土盐分过大而造成秧苗反渗透失水。因此播种、盖种和浇底水应连续作业，防止以后出现秧苗生理性立枯病，诱发大量死苗、烧苗。秧床播种后要轻轻压种，再用细土盖种，厚度1厘米左右。这样既有利于种子萌发出苗，又有利于防止肥害死苗。
