芹菜种子小，皮厚，含有油腺，最宜发芽温度为20℃，在高温干旱条件下出芽慢。生产上在夏末秋初播种时，常采用冷处理以促进发芽。如吊井中催芽，即先将种子浸12—14小时，搓洗干净，再将种子用纱袋或网袋装好，吊在井中离水面30—60厘米处催芽，每天用井水冲洗一次，3—4天后待80%的种子出芽时即可播种。此外，也可将浸种后的种子与湿润河沙混合，置于冷凉处，或将浸种后的种子用袋子装好，直接置于冰箱的冷柜中，进行低温处理，这样也可以促进芹菜种子的发芽。
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