苦瓜种子种皮坚硬，穴盘育苗前需要提前催芽。一般将种子在26-30℃温水中浸泡48-72小时，然后用布包好置于32-35℃的环境中催芽。当出芽率达到60%的时候即可播种。也可使用种子钳将苦瓜种子捏开一小口，然后进行催芽，可促进发芽。
2、穴盘用土要消毒
消毒是减少苦瓜幼苗病虫害、保证幼苗健壮生长的重要环节。一般每立方土可加50%的多菌灵100克，50%敌敌畏50克。
3、适宜发芽出苗的较高温度
苦瓜穴盘育苗时昼温要达到30-35℃，以33℃最为适宜，夜温22-28℃，以25℃左右最为适宜。
4、保证较高的湿度
苦瓜育苗基质中的水分必须充足，一般基质湿度保持在80%-85%。见干就浇水，采取控温不控水的原则，保持幼苗健壮生长。因此每天必须及时补充水分，气温高通风好时要加大补水量和补水次数，避免基质干燥，导致出苗率降低。苦瓜每天供水时间要比其他瓜类蔬菜多一倍。
