农业措施
1.清洁田园。上茬作物收获后，及时翻耕灭茬，清除田间及周边杂草，以减少田间菌源、虫源数量。
2.轮作倒茬。在小麦全蚀病和纹枯病发生重的地区，进行轮作倒茬，与非寄主作物棉花、蔬菜、甘薯等轮作两年以上。
3.选用良种。根据当地主要病虫发生种类，有针对性地筛选种植抗性品种并合理布局，淘汰高感病品种，预防病害的发生流行。小麦播种前要清除混杂在麦种内的杂草种子，降低杂草种源数量。
4.适期晚播。针对气候条件、小麦品种特性和栽培技术等，在小麦全蚀病、根腐病和纹枯病等历年重发生区域推行小麦适期晚播技术，可有效减轻病菌的侵染和发生。
化学防治
1.防治土传、种传病害。①防治小麦全蚀病。该病是典型的土传病害，要综合防治。首先选用二氯异氰尿酸进行土壤消毒，一般亩用药剂500克拌20公斤细土均匀撒施，再用12.5%硅噻菌胺悬浮剂200-300毫升，对水1000毫升，拌麦种100公斤，搅拌均匀堆闷3小时，晾干后播种。②防治小麦黑穗病、根腐病和纹枯病等，可选用3%苯醚甲环唑悬浮种衣剂30毫升，对水100-150毫升，拌麦种10-15公斤，堆闷3小时后晾干播种，或选用6%戊唑醇悬浮种衣剂60毫升，对水2000毫升，拌麦种100公斤，堆闷6小时后晾干播种。
2.防治地下害虫、早期蚜虫。防治地下害虫，可选用40%甲基异柳磷乳油100毫升，或50%辛硫磷乳油200毫升，对水5000毫升，拌麦种100公斤，拌后堆闷2-3小时，晾干后播种，或选用3%辛硫磷颗粒剂3-4公斤均匀撒施后再翻地播种。防治早期蚜虫，可选用70%吡虫啉水分散粒剂处理种子，每70克吡虫啉水分散粒剂对水1500毫升稀释成母液，均匀拌种20-25公斤，待吸收晾干后播种。
